Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  263  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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1.97
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206
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28
1.97
87066027--87066205
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2.2
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198
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7
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2
66
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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2.4
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143
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16
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1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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4
149
26
15
29
28
1.96
87189738--87189915
27
6.6
27
77
6
146
25
15
28
30
1.96
87189739--87189894
82
1.9
81
81
6
190
25
16
28
30
1.96
87208854--87209003
55
2.8
54
80
4
149
26
15
29
28
1.96
87208826--87209003
27
6.6
27
77
6
146
25
15
28
30
1.96
87208827--87208982
82
1.9
81
81
6
190
25
16
28
30
1.96
87216054--87216098
17
2.5
18
85
7
56
20
2
0
77
0.87
87216054--87216101
5
10.4
5
76
17
50
18
2
0
79
0.84
87216077--87216106
14
2.1
14
93
0
51
26
0
3
70
1.03
87216063--87216101
19
2.1
18
90
4
60
20
0
0
79
0.73
87226498--87226537
21
2.0
20
90
5
62
37
0
20
42
1.52
87231976--87232065
20
4.6
18
71
19
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38
20
28
12
1.88
87232039--87232130
40
2.3
40
76
12
100
36
18
25
19
1.94
87235901--87236073
93
1.9
93
88
0
265
28
29
20
21
1.98
87235894--87236063
46
3.7
46
77
10
184
29
29
20
21
1.98
87239234--87239320
25
3.3
26
78
10
81
36
25
20
17
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87239277--87239385
25
4.4
25
76
3
114
35
21
23
19
1.96
87240189--87240227
20
1.9
21
89
5
62
38
5
2
53
1.37
87242314--87242388
35
2.1
35
85
4
98
64
6
1
28
1.27
87242445--87242486
7
6.0
7
86
10
59
28
45
0
26
1.54
87242705--87242746
6
7.0
6
100
0
84
33
0
66
0
0.92
87242892--87242948
30
1.9
29
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3
78
33
1
1
63
1.15
87242940--87243043
51
2.0
51
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3
120
44
2
12
40
1.57
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3
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3
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0
61
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0
0
37
0.95
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25
2.0
25
100
0
100
28
12
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52
1.66
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40
3.2
40
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2
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25
26
23
24
2.00
87256418--87256861
47
9.4
47
91
1
699
32
8
29
29
1.87
87256418--87256806
143
2.7
143
95
0
692
32
8
28
30
1.86
87256425--87256861
237
1.8
237
92
0
739
32
8
29
29
1.87
87256980--87257058
37
2.1
37
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4
115
25
18
30
25
1.98
87258922--87259024
42
2.4
43
96
3
199
22
15
36
25
1.93
87259362--87259543
40
4.6
40
82
3
190
25
23
25
25
2.00
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47
6.4
47
90
1
453
31
8
30
29
1.88
87263508--87263586
37
2.1
37
88
4
115
26
18
29
25
1.98
87272611--87272780
40
4.3
40
79
3
175
25
26
23
24
2.00
87277901--87277941
21
2.0
21
85
0
55
70
0
29
0
0.87
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2.2
51
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172
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3
23
8
1.37
87277929--87278036
50
2.2
50
96
1
200
62
3
25
8
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87284509--87285164
150
4.5
150
85
6
891
28
6
7
57
1.50
87284509--87285164
290
2.2
294
87
5
933
28
6
7
57
1.50
87285202--87285234
17
1.9
17
93
0
57
15
9
0
75
1.03
87285198--87285279
17
4.9
17
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20
6
1
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1.14
87285653--87285686
10
3.5
10
88
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52
0
29
0
70
0.87
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11
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0
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0
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0
0
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0.94
87286322--87286351
14
2.1
14
93
0
51
46
0
0
53
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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