Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  39  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11071616--11071649
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17
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0
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2
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1.11
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6
0
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2.9
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1.34
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2.0
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0
0
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1.9
106
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11075642--11075673
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2.1
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18
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11083762--11084427
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15.1
44
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4
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14
29
26
1.95
11083762--11084427
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5.0
132
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912
29
14
29
26
1.95
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0
0
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2
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11086017--11086102
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5
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0
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1.35
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2.4
90
82
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242
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6
6
45
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35
93
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6.0
5
96
0
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20
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0
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0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11097313--11097374
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4.1
15
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2
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17
3
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11099900--11099984
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1.9
44
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0
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51
15
16
16
1.76
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2.2
145
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1
611
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19
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1.78
11109715--11109788
19
3.6
19
68
16
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2
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11109782--11109834
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0
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16
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0
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1
0
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1.04
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2.2
21
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2.5
27
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25
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11123011--11123059
20
2.7
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2
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11125142--11125201
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2.5
24
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2
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20
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20
30
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2.1
36
100
0
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4
4
41
1.42
11130821--11130868
20
2.6
18
78
21
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4
2
43
1.33
11130821--11130911
17
5.4
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59
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3
5
39
1.41
11135726--11136041
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22
22
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2.4
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0
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25
23
2.00
11155861--11156046
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2.0
93
100
0
372
27
21
26
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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38
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2
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23
25
27
2.00
11169326--11169480
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3.6
43
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258
10
24
34
30
1.89
11176049--11176087
20
2.0
20
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30
12
0
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1.37
11179490--11179534
21
2.1
21
84
8
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68
2
6
22
1.24
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9
432
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19
18
33
1.95
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128
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28
19
19
32
1.96
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89
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0
220
29
21
18
29
1.97
11181160--11181745
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29
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18
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16
2.0
17
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21
21
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2.1
21
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2
6
22
1.24
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1.94
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305
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18
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26
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11231442--11231611
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11247325--11247500
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19
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20
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29
1.98
11254357--11254532
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3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11254354--11254525
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0
317
20
21
29
27
1.98
11255837--11256017
90
2.0
89
88
1
263
33
14
23
27
1.94
11255848--11256043
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2.2
90
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234
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15
21
27
1.94
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15
2.0
15
100
0
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20
13
20
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30
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13
73
40
12
7
40
1.70
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1
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28
0
0
71
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26
2.0
26
96
3
95
27
0
0
72
0.85
11260957--11261020
34
2.0
33
85
11
89
29
0
0
70
0.88
11267823--11267995
46
3.7
46
79
10
199
22
20
27
29
1.99
11267820--11267991
93
1.8
93
91
0
281
22
20
27
28
1.99
11268220--11268257
19
2.0
20
85
15
53
36
0
23
39
1.55
11279459--11279506
17
2.6
17
83
9
60
14
20
45
18
1.85
11280954--11280986
17
1.9
17
93
0
57
60
6
18
15
1.54
11281152--11281191
10
4.0
10
81
12
55
22
7
2
67
1.28
11284162--11284224
30
2.1
30
90
0
99
23
4
14
57
1.56
11285346--11285389
2
22.0
2
95
0
79
0
47
0
52
1.00
11287169--11287200
3
10.7
3
100
0
64
68
0
0
31
0.90
11287304--11287338
17
2.1
17
88
0
52
54
0
0
45
0.99
11292515--11292638
59
2.1
60
81
4
153
47
15
12
24
1.80
11292606--11292782
85
2.1
85
82
4
216
41
11
13
33
1.80
11293134--11293180
14
3.4
14
78
18
53
68
2
0
29
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11296047--11296232
40
4.7
40
87
4
225
21
20
25
32
1.97
11297590--11297629
18
2.2
18
100
0
80
27
0
17
55
1.43
11300467--11300598
45
2.9
45
84
4
167
40
14
21
22
1.90
11300752--11300903
27
5.6
27
72
0
97
37
18
28
15
1.92
11303986--11304108
43
2.9
43
82
4
115
26
17
24
31
1.97
11304788--11304837
25
2.0
25
96
0
91
40
4
18
38
1.69
11312756--11312803
26
1.9
26
83
8
64
39
18
14
27
1.90
11312639--11312810
23
7.3
24
70
13
90
35
17
22
25
1.95
11318897--11318963
27
2.5
27
78
9
75
31
22
11
34
1.90
11326835--11326870
16
2.4
14
90
9
54
72
2
0
25
0.98
11326895--11326959
24
2.7
24
100
0
130
33
18
15
32
1.92
11330856--11330893
3
12.7
3
94
0
67
68
2
0
28
1.03
11334619--11334676
18
3.4
17
84
11
75
34
5
0
60
1.19
11334620--11334744
15
7.9
15
72
22
71
32
4
0
64
1.12
11334652--11334734
30
2.7
30
92
1
139
31
2
0
66
1.05
11334670--11334726
17
3.6
16
73
22
57
31
3
0
64
1.10
11334694--11334780
23
3.5
24
77
13
79
29
2
2
65
1.17
11336753--11336783
11
2.8
11
100
0
62
16
0
0
83
0.64
11341367--11341412
20
2.3
20
92
0
74
39
0
2
58
1.10
11341829--11341879
19
2.6
19
81
3
57
66
3
1
27
1.20
11344499--11344545
20
2.3
21
85
3
60
55
0
2
42
1.12
11344796--11344882
42
2.1
42
93
0
147
26
12
28
32
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11350901--11350946
15
2.9
16
73
26
53
63
2
4
30
1.26
11352027--11352087
26
2.4
25
83
10
70
50
1
0
47
1.10
11352050--11352107
26
2.2
28
81
12
77
48
5
1
44
1.35
11359394--11359625
125
1.9
124
82
5
290
31
10
4
53
1.54
11359974--11360014
21
1.9
21
85
5
55
68
0
4
26
1.10
11361388--11361427
5
8.4
5
86
13
50
22
0
0
77
0.77
11361435--11361503
22
3.0
22
78
15
77
42
0
4
53
1.20
11361506--11361549
22
2.0
23
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4
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38
2
0
59
1.10
11361577--11361618
21
2.0
21
86
9
59
42
0
0
57
0.99
11361596--11361634
14
2.7
15
88
4
53
38
0
2
58
1.12

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333