Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   

This is table  26  of  333  ( 39894 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7443277--7443393
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22
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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0
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2.7
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9
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2
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24
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56
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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5
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268
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11
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57
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9
0
87
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5
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0
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0
41
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7526358--7526421
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2.0
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3
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0
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30
1.14
7563058--7563136
4
20.0
4
70
21
51
70
1
24
3
1.11
7563063--7563132
30
2.5
28
84
11
90
71
1
24
2
1.08
7567386--7567524
3
45.0
3
72
14
79
62
2
5
30
1.28
7571458--7571593
49
2.8
48
76
6
148
26
29
19
25
1.98
7577447--7577519
26
2.8
26
87
2
94
38
16
5
39
1.72
7581320--7581348
13
2.1
14
93
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51
17
6
0
75
1.01
7583988--7584065
31
2.5
31
89
0
111
20
11
16
51
1.75
7587863--7587919
28
2.0
28
83
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50
3
0
45
1.18
7589309--7589441
56
2.3
57
83
8
173
40
0
3
54
1.23
7589390--7589455
27
2.4
28
75
12
66
42
0
3
54
1.15
7589403--7589459
25
2.2
26
84
6
71
42
0
3
54
1.17
7589463--7589531
27
2.3
32
80
14
85
53
0
0
46
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7596121--7596145
7
3.6
7
100
0
50
0
44
0
56
0.99
7596859--7596901
21
2.0
21
82
8
52
53
2
2
41
1.26
7597391--7597448
22
2.6
22
94
0
98
29
55
3
12
1.53
7601576--7601652
38
2.0
38
100
0
154
32
18
15
33
1.92
7603962--7603994
15
2.3
15
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5
50
72
12
0
15
1.12
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24
1.9
24
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0
65
23
4
2
69
1.17
7604800--7604838
12
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13
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13
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23
5
0
71
1.05
7604904--7604940
3
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3
100
0
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0
0
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11
3.7
11
80
0
55
19
14
9
56
1.66
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30
2.0
30
90
0
95
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6
11
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1.59
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18
2.2
18
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8
55
17
0
15
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1.23
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12
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12
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0
50
67
0
0
32
0.91
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78
2.9
78
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1
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30
22
14
32
1.94
7612167--7612304
40
3.5
40
84
0
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36
22
11
29
1.90
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46
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46
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14
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21
1.90
7618102--7618455
137
2.6
138
88
0
476
40
14
23
20
1.90
7618736--7618768
17
2.0
17
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5
59
48
0
15
36
1.45
7620531--7620574
9
5.1
9
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15
58
43
0
31
25
1.55
7621237--7621274
7
5.1
7
90
9
58
81
2
0
15
0.80
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2
16.0
2
100
0
64
0
50
0
50
1.00
7630888--7631126
88
2.8
86
81
5
225
31
12
13
43
1.81
7630957--7631119
88
1.9
87
90
1
263
30
11
14
43
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7633330--7633382
23
2.2
23
83
6
61
54
3
5
35
1.42
7633704--7633737
3
11.3
3
100
0
68
67
0
0
32
0.91
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16
2.1
16
94
0
59
35
5
11
47
1.65
7641082--7641111
7
4.1
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91
8
51
86
0
13
0
0.57
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17
2.9
16
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21
51
57
0
0
42
0.98
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7
5.7
7
84
9
53
44
26
2
26
1.67
7648088--7648136
14
3.6
14
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17
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2
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2.0
39
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10
1
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1.40
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0
0
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1.00
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24
3.7
23
76
19
89
40
1
2
55
1.21

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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