Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  180  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59110610--59110634
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2.2
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3
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1.96
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2.2
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43
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26
19
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.99
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29
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29
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1.9
91
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1
313
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30
20
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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27
20
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59285402--59285526
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19
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33
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9
89
23
18
25
32
1.97
59294665--59294766
43
2.4
42
85
4
134
27
24
18
29
1.98
59294664--59294777
43
2.7
41
80
9
122
27
24
17
30
1.97
59304070--59304132
13
4.7
13
73
7
54
39
14
1
44
1.55
59304086--59304150
13
4.8
13
75
14
60
35
10
0
53
1.36
59304081--59304137
28
2.0
28
86
0
78
36
12
0
50
1.40
59304045--59304194
41
3.7
41
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7
155
38
14
1
46
1.54
59306997--59307259
120
2.2
120
81
7
304
26
21
26
25
1.99
59306997--59307259
40
6.6
40
84
4
264
26
21
26
25
1.99
59314996--59315258
120
2.2
120
81
6
302
26
21
26
25
1.99
59314996--59315258
40
6.6
40
84
4
264
26
21
26
25
1.99
59315110--59315293
79
2.3
80
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3
212
27
20
27
25
1.99
59319524--59319731
46
4.4
47
78
10
178
29
20
27
23
1.99
59319509--59319692
94
2.0
93
82
6
228
27
20
28
22
1.99
59319518--59319767
140
1.8
139
82
11
307
27
20
27
24
1.99
59323761--59323815
22
2.5
21
82
8
74
43
0
12
43
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59324726--59324750
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11
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0
50
16
0
0
84
0.63
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17
1.9
17
100
0
66
36
9
12
42
1.74
59339540--59339757
39
5.5
39
93
1
339
19
22
27
29
1.98
59341743--59341797
27
2.0
27
96
0
101
56
3
1
38
1.28
59350134--59350189
15
3.7
15
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7
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12
16
10
60
1.58
59352110--59352282
46
3.7
46
76
13
183
21
21
28
28
1.99
59352107--59352277
93
1.8
93
92
0
288
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21
29
27
1.99
59355731--59355800
25
2.8
25
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0
131
24
25
25
24
2.00
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20
1.9
20
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0
58
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21
10
36
1.87
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12
3.5
12
78
12
50
52
0
2
45
1.13
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14
3.8
13
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15
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55
0
0
44
0.99
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3.2
20
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1
3
25
1.11
59358601--59358708
15
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17
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20
74
62
0
2
34
1.09
59358551--59358707
13
12.7
13
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28
62
63
0
3
31
1.17
59358546--59358713
16
10.9
15
68
21
73
64
0
3
31
1.15
59358608--59358714
32
3.2
32
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13
103
63
0
2
33
1.09
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408
2.2
410
92
0
1514
29
21
18
30
1.97
59360365--59361263
205
4.4
205
93
0
1514
29
21
18
30
1.97
59373100--59373137
12
3.2
12
82
14
51
55
0
2
42
1.14
59373106--59373146
12
3.2
13
83
16
59
53
0
0
46
1.00
59373256--59373301
23
2.0
23
82
0
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52
6
6
34
1.53
59379990--59380068
37
2.1
37
86
4
106
26
30
17
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59380187--59380645
47
10.1
47
87
7
624
28
29
9
32
1.89
59380187--59380645
93
5.0
94
86
6
624
28
29
9
32
1.89
59380442--59380512
34
2.1
35
97
2
135
29
30
11
28
1.91
59380394--59380641
81
2.9
85
87
7
342
29
28
9
31
1.89
59380238--59380603
128
2.8
128
87
7
484
30
28
8
32
1.87
59401960--59402062
47
2.2
47
94
0
179
33
8
29
29
1.87
59404220--59404410
40
4.8
40
87
2
242
22
24
29
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1.99
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40
87
3
235
23
23
29
24
1.99
59419504--59419673
27
6.3
27
82
2
162
25
14
16
43
1.85
59419504--59419673
54
3.1
54
84
5
182
25
14
16
43
1.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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