Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  275  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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91220738--91220896
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1.20
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Period
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Copy
Number
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Percent
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Indels
Score
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29
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1.9
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224
26
14
29
29
1.95
91296570--91296750
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2.2
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220
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2.0
25
88
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2
24
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.98
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20.4
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205
19
19
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38
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91321055--91321211
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1.95
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26
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1.84
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0
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2.7
28
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28
0
25
1.53
91330499--91330523
7
3.6
7
100
0
50
32
32
12
24
1.91
91330478--91330528
14
3.6
14
81
0
57
41
31
5
21
1.77
91330382--91330509
21
6.1
21
66
3
69
45
30
0
23
1.59
91332010--91332038
14
2.1
14
93
6
51
34
0
10
55
1.34
91332480--91332519
21
1.9
21
84
0
53
37
10
45
7
1.66
91335306--91335359
26
2.1
26
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6
74
61
0
1
37
1.07
91335353--91335397
20
2.2
20
88
0
63
66
2
8
22
1.30
91335665--91335795
10
13.6
9
66
16
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33
3
2
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1.24
91335664--91335795
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34
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2
60
1.24
91335766--91335814
19
2.5
19
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36
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1.37
91337853--91337941
39
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39
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0
178
42
7
16
32
1.77
91339502--91339540
16
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16
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0
51
33
5
28
33
1.79
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26
2.0
25
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3
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43
0
3
52
1.19
91339665--91339803
57
2.4
57
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167
50
3
1
44
1.28
91345703--91345886
62
3.0
62
95
0
323
41
20
4
33
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91347119--91347163
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3.8
12
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14
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4
8
2
0.84
91347118--91347180
14
4.6
14
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20
55
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4
9
3
0.92
91347120--91347162
11
3.7
11
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12
52
83
4
9
2
0.87
91347132--91347182
23
2.3
21
83
6
57
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3
7
3
0.86
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40
2.1
39
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3
0.96
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20
3.0
20
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80
0
15
5
0.88
91347617--91347668
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7.7
7
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80
0
15
3
0.85
91347617--91347668
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0
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27
17
25
29
1.97
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3.0
134
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24
29
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4.4
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1.98
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2.4
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1.97
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3.2
45
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27
19
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28
1.98
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2.5
32
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22
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30
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2.2
21
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91359470--91359680
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87
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248
36
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1.91
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91359560--91360065
228
2.2
234
84
8
656
35
18
14
31
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91372254--91372309
20
2.6
22
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10
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53
5
7
33
1.51
91372254--91372321
23
3.1
22
75
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52
4
8
33
1.52
91372381--91372451
25
2.8
26
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56
4
5
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1.42
91372385--91372466
25
3.5
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1.40
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21
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0
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0
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9
3.6
9
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11
50
67
0
0
32
0.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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