Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  41  of  333  ( 39894 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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Period
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Score
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298
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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38
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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(0-2)
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2.0
19
89
5
58
32
27
8
32
1.86
11828458--11828496
18
2.1
18
85
4
51
38
7
15
38
1.76
11830088--11830259
3
58.0
3
70
15
83
59
2
4
33
1.31
11830085--11830259
8
21.1
8
66
23
60
60
2
4
33
1.30
11830143--11830227
35
2.3
35
86
6
116
65
4
3
25
1.28
11831691--11831857
44
3.8
44
75
6
140
29
21
18
29
1.97
11831924--11832085
44
3.7
44
79
2
155
33
19
15
31
1.93
11833408--11833583
46
3.8
46
80
4
210
21
21
28
28
1.98
11833405--11833575
93
1.8
93
93
0
297
21
21
29
27
1.99
11839554--11839587
16
2.1
16
88
5
50
32
14
0
52
1.42
11839807--11840034
46
5.0
46
87
1
296
23
22
14
39
1.91
11845831--11845863
17
2.0
17
94
5
59
36
15
0
48
1.45
11846149--11846513
46
7.9
46
89
0
489
21
23
14
40
1.90
11846149--11846513
92
4.0
92
92
0
541
21
23
14
40
1.90
11848941--11849008
30
2.3
30
84
5
84
27
19
5
47
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11852050--11852311
3
88.0
3
73
12
105
58
4
4
32
1.40
11852047--11852149
8
12.2
8
70
16
50
60
0
4
33
1.25
11852087--11852145
26
2.3
26
85
5
75
66
1
5
27
1.22
11852830--11852860
8
3.8
8
91
8
53
12
0
0
87
0.55
11852831--11852860
9
3.4
9
95
4
53
10
0
0
90
0.47
11855317--11855341
13
1.9
13
100
0
50
32
0
4
64
1.12
11855799--11855836
20
1.9
20
84
10
51
42
5
0
52
1.24
11857630--11857886
126
2.0
126
87
0
370
25
20
28
26
1.99
11860147--11860254
15
7.2
15
66
12
69
45
7
21
25
1.78
11860141--11860264
30
4.1
30
92
1
194
44
6
23
25
1.77
11864840--11864947
15
7.2
15
67
12
78
44
7
22
25
1.79
11864834--11864957
30
4.1
30
93
1
203
43
6
24
25
1.78
11868413--11868455
21
2.0
21
95
0
77
27
4
20
46
1.71
11871816--11871874
29
2.0
29
86
0
82
22
25
38
13
1.90
11873145--11873261
43
2.7
43
82
10
141
28
16
22
33
1.95
11873122--11873271
44
3.5
43
78
10
146
28
16
24
32
1.96
11885348--11885459
24
4.7
24
86
0
152
36
29
14
19
1.91
11891759--11891787
14
2.0
15
93
6
51
55
0
44
0
0.99
11892225--11892255
10
3.1
10
90
0
53
12
19
0
67
1.22
11896818--11897394
51
11.9
51
70
14
280
30
19
16
33
1.94
11896879--11897523
45
13.8
45
69
14
351
29
19
17
33
1.95
11896825--11897554
96
7.7
96
74
10
567
29
20
16
33
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11896875--11897244
141
2.6
136
79
10
361
30
20
16
32
1.95
11896971--11897476
141
3.6
138
79
9
509
29
19
17
33
1.95
11897347--11897525
85
2.1
87
84
4
227
26
18
17
36
1.94
11898613--11898653
22
1.9
21
85
14
57
51
19
14
14
1.77
11900203--11900311
26
4.2
26
95
0
200
35
25
6
32
1.81
11900650--11900925
44
6.4
44
71
12
155
32
19
17
30
1.95
11915115--11915171
25
2.3
23
82
8
60
29
14
3
52
1.58
11916795--11916848
23
2.3
24
84
12
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48
0
3
48
1.19
11926257--11926309
25
2.1
25
96
0
97
52
9
15
22
1.70
11927483--11927518
14
2.6
14
91
4
56
41
2
0
55
1.14

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333