Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  57  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16666415--16667381
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16666415--16667447
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1362
33
20
16
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1.94
16666431--16667447
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3.4
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16667563--16667738
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2.0
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1.9
19
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13
100
0
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51
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16713170--16713243
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2
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24
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22
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0
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4.6
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19
29
1.98
16752009--16752222
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2.3
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258
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1.98
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2.1
30
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56
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2.5
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17
27
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16782006--16782467
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3.2
144
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811
24
30
17
27
1.97
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144
2.1
144
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0
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29
17
28
1.97
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48
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362
23
29
17
29
1.97
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24
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2.5
20
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0
73
38
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20
24
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16806399--16806555
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1.85
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1.39
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16
2.0
16
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25
1.98
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17
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28
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1.27
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16843989--16844661
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23
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1.90
16843989--16844661
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1.90
16844696--16844803
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2.0
54
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0
207
32
22
16
28
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16846819--16846853
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3.2
11
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68
0
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28
1.04
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2.4
18
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19
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2
57
1.52
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28
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1.51
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51
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0
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0
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1.11
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7.7
46
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14
247
21
30
21
27
1.98
16859630--16859987
94
3.8
94
77
8
347
21
30
20
27
1.98
16859630--16859987
141
2.6
139
78
8
386
21
30
20
27
1.98
16867700--16867735
5
7.0
5
93
6
63
38
0
0
61
0.96
16869331--16869497
48
3.5
48
96
1
318
43
0
17
38
1.50
16876914--16877081
48
3.5
48
97
0
318
43
0
17
38
1.50
16878275--16878310
17
2.1
17
100
0
72
22
11
41
25
1.86
16888845--16888896
26
2.0
26
81
7
61
23
3
3
69
1.22
16889220--16889258
17
2.3
17
86
0
51
23
5
2
69
1.21
16898863--16898924
3
21.0
3
81
3
72
69
0
27
3
1.04
16900921--16901535
44
13.6
44
71
10
303
32
18
19
28
1.96
16900921--16901415
89
5.5
88
74
6
357
33
18
19
27
1.96
16901058--16901497
228
1.9
228
84
2
589
33
18
19
28
1.96
16901765--16901817
27
2.0
26
85
3
70
49
30
9
11
1.70
16903353--16903391
17
2.3
17
86
0
51
23
5
2
69
1.21
16905621--16905879
132
2.0
132
81
6
310
33
23
14
28
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16909281--16909319
10
3.9
10
86
0
60
66
2
10
20
1.33
16909281--16909318
20
1.9
20
94
0
67
65
2
10
21
1.35
16914630--16914686
25
2.3
25
82
8
64
24
7
7
61
1.47
16914682--16914739
30
1.9
30
92
0
98
18
13
6
60
1.55
16914683--16914747
30
2.2
30
83
2
87
20
13
7
58
1.60
16916560--16916677
31
3.8
31
81
0
146
28
26
16
27
1.97
16916560--16916676
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1.9
62
85
0
162
29
26
17
27
1.97
16920147--16920206
20
2.9
21
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1
3
58
1.25
16920821--16920849
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2.1
14
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6
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55
3
0
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1.17
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20
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10
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36
0
14
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1.44
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50
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50
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404
25
17
26
31
1.97
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151
2.9
151
88
2
637
24
17
26
31
1.97
16925064--16925448
101
3.8
103
77
7
335
25
17
26
30
1.97
16925648--16925679
16
2.0
16
93
0
55
46
0
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2.0
15
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0
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0
0
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0.95
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30
2.1
30
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18
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0
26
1.44
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2.0
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60
71
2
25
0
0.98
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5
6.0
5
100
0
60
60
40
0
0
0.97
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22
1.9
24
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56
50
15
6
27
1.70
16939718--16939761
19
2.3
19
84
7
54
43
0
4
52
1.22
16940562--16940597
18
2.0
18
100
0
72
61
5
0
33
1.19
16940630--16940697
29
2.3
29
84
0
82
29
20
4
45
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16941138--16941176
20
2.0
20
85
5
53
20
0
5
74
1.01
16950038--16950119
29
2.9
29
85
1
94
45
25
6
23
1.76
16950054--16950119
29
2.3
29
91
0
105
39
27
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25
1.83
16964571--16964639
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1.9
36
93
0
120
44
8
8
37
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16967102--16967154
25
2.1
25
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0
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1
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16979242--16979403
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42
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1
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33
17
22
27
1.96
16979250--16979405
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1.9
84
87
0
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32
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0
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15
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10
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0
27
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65
2.4
65
76
4
150
23
27
27
21
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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