Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  50  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14411229--14411360
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1
0
23
0.90
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2.5
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17
109
71
0
2
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1.05
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0
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0
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299
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2.2
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16
33
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1.94
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1.9
30
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19
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0
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72
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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14461064--14461108
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2.0
23
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2.4
25
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169
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23
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100
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2.0
23
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64
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0
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2.3
27
80
13
72
27
0
6
65
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
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(0-2)
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66
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16
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1.90
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32
16
22
28
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1.97
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1.96
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17
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1.62
14559644--14559692
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4.4
11
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14
55
40
20
0
38
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14559861--14560036
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2.0
30
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10
1
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1.43
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1
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2
2
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0
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0
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1.92
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2.0
62
98
0
241
28
18
25
27
1.98
14564562--14564878
48
6.6
48
81
7
306
28
19
27
24
1.98
14564562--14564880
142
2.2
143
81
5
349
28
19
27
24
1.98
14567010--14567164
43
3.7
41
79
10
170
23
16
28
30
1.96
14570653--14570727
33
2.3
33
88
0
105
22
30
10
36
1.88
14572185--14572232
20
2.5
20
82
3
62
41
18
18
20
1.90
14573192--14573240
22
2.2
22
92
0
80
26
38
18
16
1.91
14587447--14587581
70
1.9
70
95
0
243
39
11
17
31
1.85
14588809--14588994
55
3.4
55
87
0
255
23
29
24
23
1.99
14596698--14596900
62
3.3
62
97
0
379
49
10
13
26
1.75
14606594--14606851
27
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27
87
3
285
38
22
15
24
1.92
14606648--14606835
104
1.8
104
95
0
340
36
24
15
22
1.94
14606621--14606851
52
4.4
52
86
5
304
38
22
15
24
1.92
14609475--14609518
17
2.5
17
81
3
52
70
0
4
25
1.06
14610406--14610472
32
2.1
32
94
0
116
43
4
16
35
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14612007--14612041
17
2.1
17
100
0
70
37
0
17
45
1.48
14614278--14614324
18
2.6
18
89
0
76
25
23
0
51
1.49
14627007--14627064
19
3.0
20
82
5
64
32
0
3
63
1.11
14629241--14629284
3
14.3
3
95
4
79
65
0
34
0
0.93
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20
2.0
21
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4
57
26
17
17
39
1.91
14647287--14647324
2
19.0
2
100
0
76
0
0
50
50
1.00
14656791--14656844
21
2.6
19
85
14
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62
0
3
33
1.12
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2.1
32
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0
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10
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50
1.65
14659114--14659175
32
2.0
32
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1.61
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22
2.2
22
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0
60
22
25
16
35
1.95
14665788--14665838
22
2.4
22
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3
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21
23
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1.89
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2.1
35
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0
135
38
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9
18
1.83
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29
2.3
27
80
15
69
69
0
9
21
1.16
14676191--14676247
29
1.9
30
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3
71
57
19
3
19
1.54
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16
2.0
15
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41
0
0
58
0.98
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18
1.9
18
100
0
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40
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22
1.88
14692636--14692782
35
4.1
35
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6
154
38
27
14
19
1.91
14692688--14692784
35
2.8
35
93
0
158
37
27
17
17
1.92
14693812--14693935
62
2.0
62
100
0
248
25
12
8
53
1.66
14702489--14702530
7
5.7
7
89
10
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0
11
2
85
0.68
14702489--14702530
8
5.5
8
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2
61
0
11
2
85
0.68
14705384--14705572
59
3.2
57
68
19
152
41
3
4
50
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14705411--14705609
66
3.2
64
68
19
186
41
3
6
49
1.42
14705373--14705670
120
2.5
120
91
2
483
42
3
4
50
1.38
14705446--14705633
61
3.1
61
69
17
183
42
2
6
49
1.40
14705498--14705549
15
3.6
15
80
12
56
44
0
1
53
1.11
14705884--14705935
16
3.2
16
94
0
95
40
34
0
25
1.56
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9
3.2
9
100
0
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34
0
20
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1.52
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13
2.0
13
100
0
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23
38
1.83
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19
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1.81
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56
100
0
226
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19
10
35
1.86
14728837--14728890
28
2.0
27
82
7
65
50
5
3
40
1.44

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333