Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  67  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20213943--20213974
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0
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2.0
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4.0
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0
2
46
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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28
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143
28
12
26
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20322257--20322407
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1.92
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2.9
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20
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20
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0.74
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29
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5.1
16
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8
78
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1
0
54
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
0
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65
45
1
0
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1.07
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20
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20
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23
5
32
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1.78
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70
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51
7
10
30
1.64
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26
2.7
26
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51
14
2
31
1.57
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2.7
25
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1
1
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1176
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29
20
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1.88
20368187--20368252
33
2.0
33
96
0
123
21
31
12
34
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20368220--20368617
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29
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1.86
20367682--20368617
270
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270
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2
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29
29
8
33
1.87
20368220--20368638
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1.86
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14
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22
19
28
1.98
20412397--20412450
28
1.9
28
85
7
74
38
24
3
33
1.73
20415597--20415646
21
2.4
21
86
0
64
28
6
16
50
1.68
20418324--20418370
22
2.2
21
84
3
58
36
21
8
34
1.84
20418343--20418393
19
2.9
16
78
18
57
35
17
9
37
1.83
20418341--20418383
19
2.1
21
91
8
72
34
18
9
37
1.83
20418785--20419716
206
4.5
206
91
0
1418
29
21
17
31
1.96
20419687--20420196
44
11.7
43
76
8
379
28
24
17
30
1.97
20419679--20420195
88
5.9
87
76
10
419
27
24
17
30
1.97
20419679--20420034
132
2.7
132
93
0
595
28
24
16
30
1.96
20421048--20421114
7
8.7
7
75
15
53
5
10
0
83
0.80
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9
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14
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5
11
0
83
0.80
20421054--20421117
10
6.3
10
75
18
53
4
10
0
84
0.76
20421048--20421117
32
2.3
30
85
7
95
5
10
0
84
0.78
20421048--20421116
16
4.3
16
81
7
86
5
10
0
84
0.78
20426654--20426697
22
2.0
21
86
4
61
43
20
6
29
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20426681--20426778
19
5.2
19
83
7
128
36
15
9
38
1.79
20426667--20426771
36
2.8
36
82
7
120
37
15
10
37
1.82
20427103--20427171
35
2.0
35
86
8
97
44
18
2
33
1.65
20430633--20430699
29
2.4
28
87
5
107
43
7
23
25
1.80
20430636--20430712
29
2.7
29
87
2
93
42
7
23
25
1.81
20430912--20430980
33
2.1
32
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2
93
40
2
14
42
1.61
20433127--20433180
27
2.0
28
85
3
74
53
16
11
18
1.72
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49
5.5
47
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20
28
1.98
20439975--20440145
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1.8
93
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231
22
30
21
25
1.99
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20
2.9
21
73
14
61
37
0
15
47
1.45
20459206--20459272
20
3.3
20
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19
59
35
0
14
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1.44
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4.0
21
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0
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16
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12
2.8
12
100
0
66
0
33
27
39
1.57
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13
203
24
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26
1.97
20467793--20468134
47
7.3
47
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15
194
24
30
18
27
1.98
20477930--20477970
20
2.0
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59
65
0
0
34
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23
2.1
24
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3
82
65
14
10
10
1.47
20487661--20487740
39
2.1
39
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0
151
30
13
20
36
1.91
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5.7
40
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7
246
25
21
27
25
2.00
20506639--20506895
79
3.3
79
80
9
197
26
21
27
24
1.99
20513888--20514111
40
5.7
40
85
7
264
24
22
28
24
2.00
20513888--20514111
79
2.8
80
84
8
278
24
22
28
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20513941--20514113
78
2.2
78
85
6
197
25
21
28
24
1.99
20514899--20514983
42
2.0
42
100
0
170
38
11
14
35
1.82
20517595--20517655
29
2.1
30
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32
24
1
40
1.65
20527583--20527660
39
2.0
39
97
0
147
37
7
24
30
1.83
20544140--20544333
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47
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0
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1.89
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275
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28
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1.84
20544303--20544487
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48
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5
264
36
7
25
30
1.84
20544633--20544741
37
2.9
37
91
0
173
24
19
29
26
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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