Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  54  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15699498--15699554
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15699621--15699679
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28
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2.0
30
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1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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23
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2.8
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22
21
1.98
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6.9
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13
24
21
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17
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48
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64
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Score
A
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(0-2)
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19
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0
2
47
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15896320--15896477
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43
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12.5
14
69
11
51
43
30
2
23
1.66
15902588--15902643
22
2.6
21
81
13
69
44
28
1
25
1.64
15902586--15902779
7
26.6
7
71
10
75
45
28
1
24
1.62
15902739--15902790
14
3.7
14
78
0
59
48
25
1
25
1.62
15902892--15902959
29
2.3
30
75
14
70
29
4
4
61
1.35
15903058--15903340
41
6.9
41
86
2
374
29
19
21
29
1.98
15903428--15903519
39
2.3
40
78
12
91
27
20
19
32
1.97
15905620--15905650
14
2.2
14
100
0
62
29
6
29
35
1.82
15907878--15907956
36
2.3
36
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8
103
65
0
1
32
1.00
15907883--15907977
10
10.4
9
71
17
56
65
1
1
32
1.07
15907935--15907978
20
2.2
20
88
8
63
72
2
0
25
0.96
15907901--15907957
8
6.6
8
75
15
51
66
0
1
31
1.02
15908333--15908397
31
2.1
31
88
0
94
38
9
21
30
1.85
15909609--15909652
14
3.2
14
83
3
54
40
0
2
56
1.11
15910103--15910145
15
2.6
16
82
14
52
60
0
2
37
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15910276--15910341
29
2.4
27
80
7
69
43
0
7
48
1.31
15915539--15915595
30
1.9
30
85
0
78
38
7
24
29
1.82
15921510--15921691
96
1.9
96
91
2
303
10
34
16
38
1.83
15925958--15926001
4
11.0
4
85
0
61
25
4
0
70
1.06
15926008--15926041
13
2.6
13
100
0
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32
0
8
58
1.29
15926162--15926228
8
8.5
8
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12
50
28
4
1
65
1.21
15935252--15935281
3
9.7
3
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7
51
66
0
30
3
1.07
15938677--15938995
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4.5
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9
23
1.72
15938819--15939002
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2.6
70
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214
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15
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21
1.70
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213
2.2
212
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3
679
50
14
10
24
1.74
15938819--15939147
69
4.7
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70
11
211
51
13
10
24
1.73
15939103--15939179
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2.0
39
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0
100
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11
25
1.63
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3.0
33
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0
153
19
10
39
31
1.85
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23
2.4
22
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20
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18
1
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1.25
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4.8
18
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17
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10
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1
65
1.30
15949897--15949949
23
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22
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20
56
9
18
1
69
1.25
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12
2.3
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51
75
0
0
24
0.80
15953678--15953730
23
2.4
22
76
20
56
9
18
1
69
1.25
15956088--15956116
12
2.3
13
94
5
51
75
0
0
24
0.80
15959863--15959896
4
8.0
4
93
6
50
76
0
0
23
0.79
15971532--15971582
18
2.8
18
79
8
59
5
25
0
68
1.12
15971532--15971571
17
2.2
19
86
8
57
5
25
0
70
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15973844--15973876
12
3.0
11
87
12
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75
0
0
24
0.80
15975222--15975274
23
2.4
22
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20
56
9
18
1
69
1.25
15978996--15979048
23
2.4
22
76
20
56
9
18
1
69
1.25
15982791--15982843
23
2.4
22
76
20
56
9
18
1
69
1.25
15988911--15989132
104
2.1
104
85
1
293
31
11
16
40
1.84
15991312--15991519
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2.3
91
92
0
335
45
3
4
46
1.39
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2.2
28
85
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81
45
0
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50
1.17
15991352--15991494
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1.31
15991546--15991733
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3.2
57
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20
152
41
3
4
51
1.37
15991535--15991831
119
2.5
120
92
2
499
42
2
5
49
1.38

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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