Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   

This is table  24  of  333  ( 39894 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6945543--6946025
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4
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6945773--6946146
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1.91
6946025--6946200
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2.5
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203
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15
3.6
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3
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6947094--6947150
20
2.7
21
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80
3
1
8
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6947115--6947161
20
2.3
20
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3
67
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1
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2.1
19
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0
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2.9
35
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38
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3.0
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0
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2
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0
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0
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1.9
134
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294
40
2
3
53
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
25
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2.3
27
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0
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20
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4
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2.3
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16
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20
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6
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6
88
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2.0
25
96
0
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5
3
39
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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2
16
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20
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16
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1
12
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20
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3.0
136
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397
22
21
18
37
1.94
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29
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17
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206
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18
22
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7082041--7083081
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1.98
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2.0
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19
22
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1.98
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2.0
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30
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1.9
16
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6
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53
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3
10
1.51
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10
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30
9
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0
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2.4
18
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0
68
34
16
34
13
1.88
7089465--7089508
15
2.9
15
82
0
61
36
15
34
13
1.87
7092437--7092481
11
3.9
11
80
11
54
35
0
2
62
1.08
7094064--7094205
33
4.3
33
70
12
103
32
17
25
24
1.97
7094130--7094219
33
2.7
33
72
6
85
31
17
25
25
1.97
7094233--7094354
45
2.7
45
77
7
124
38
14
22
23
1.92
7094326--7094484
46
3.5
45
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5
221
47
13
20
19
1.82
7094456--7094511
29
1.9
29
88
0
85
50
7
23
19
1.72
7096503--7096601
25
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25
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32
27
14
26
1.94
7096495--7096583
44
2.0
44
100
0
178
33
24
15
25
1.95
7099960--7100174
46
4.7
44
73
15
150
25
30
18
26
1.98
7102144--7102168
3
8.3
3
100
0
50
36
0
0
64
0.94
7102428--7102511
42
2.0
42
97
0
159
52
2
25
20
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7102616--7102775
80
2.0
80
98
0
311
41
1
15
41
1.54
7106125--7106157
17
2.0
17
94
5
59
36
15
0
48
1.45
7106438--7106618
46
4.0
46
86
2
240
19
23
14
42
1.88
7106443--7106618
92
1.9
91
89
1
271
19
23
14
43
1.87
7106592--7106643
23
2.4
22
87
6
70
25
19
9
46
1.80
7106624--7106736
46
2.5
46
94
2
201
23
22
14
40
1.90
7107018--7107071
26
2.1
26
89
6
83
42
16
1
38
1.59
7111590--7111622
17
2.0
17
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59
36
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0
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1.45
7111902--7112036
46
3.0
46
89
3
184
20
23
14
42
1.88
7112042--7112155
46
2.5
46
97
1
212
23
22
14
38
1.92
7112497--7112550
26
2.1
26
89
6
83
42
16
1
38
1.59
7118977--7119061
43
2.0
42
84
6
109
25
11
22
40
1.88
7119700--7119739
15
2.6
16
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11
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40
5
0
55
1.22
7123817--7123935
60
2.0
60
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6
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6
29
26
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1.82
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43
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43
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0
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10
1.89
7129575--7129698
38
3.2
38
89
2
167
27
27
23
21
1.99
7135172--7135216
11
4.1
11
80
11
56
15
2
2
80
0.92
7135172--7135219
16
2.9
16
79
14
62
16
2
2
79
0.93
7140312--7140354
11
4.0
11
78
3
52
32
2
44
20
1.65
7144401--7144493
18
5.2
18
86
0
132
32
16
22
29
1.95
7144401--7144493
36
2.6
36
91
0
150
32
16
22
29
1.95
7145026--7145068
11
4.0
11
78
3
52
32
2
44
20
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7146717--7146763
16
3.0
16
93
3
78
51
0
0
48
1.00
7146782--7146819
17
2.2
17
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9
51
52
10
2
34
1.50
7148572--7148632
24
2.5
24
81
5
70
39
18
31
11
1.86
7159389--7159439
17
3.1
16
81
10
57
27
13
5
52
1.63
7161987--7162040
27
2.0
27
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0
99
40
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7
20
1.80
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9.7
46
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0
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24
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0
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1.56
7193725--7193770
23
2.0
23
100
0
92
8
4
34
52
1.52

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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