Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  48  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13863093--13863644
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104
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13863093--13863652
207
2.7
207
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0
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12
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14
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13921131--13921167
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2
0
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0.81
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21
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2.9
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0
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0
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Score
A
C
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(0-2)
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0
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0
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59
57
0
0
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1.9
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149
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12
43
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13969931--13969974
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1.9
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2
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1.9
104
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19
9
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1.84
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2.6
22
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3
35
1.66
13971619--13971662
23
2.0
21
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15
100
0
66
24
12
21
42
1.86
13978208--13978314
55
1.9
55
90
0
169
40
9
11
39
1.73
13978784--13978822
20
2.0
20
85
10
53
48
5
15
30
1.66
13979779--13979888
38
2.9
38
90
1
177
36
29
22
11
1.90
13984802--13984858
28
2.0
28
93
0
96
33
15
12
38
1.85
13988257--13988373
58
2.0
58
96
3
218
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34
7
22
1.83
13995543--13995647
27
3.9
27
90
7
160
34
22
24
18
1.96
13997243--13997324
26
3.2
26
98
0
155
35
25
7
31
1.84
13997668--13997696
13
2.3
13
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51
27
0
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1.56
14005450--14005564
27
4.3
26
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7
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22
22
19
1.96
14008240--14008315
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38
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0
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21
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1.76
14011169--14011195
11
2.5
11
100
0
54
37
11
14
37
1.82
14017941--14018034
28
3.5
26
85
8
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39
22
23
14
1.91
14017959--14018051
28
3.3
28
83
5
100
35
23
22
18
1.96
14017941--14018057
56
2.1
54
81
6
128
37
22
22
17
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14019664--14019773
26
4.2
26
95
2
177
36
24
4
34
1.76
14023711--14023825
27
4.3
26
87
5
149
36
23
23
16
1.94
14023711--14023825
54
2.1
54
88
3
169
36
23
23
16
1.94
14025432--14025541
26
4.2
26
95
2
177
36
24
4
34
1.76
14029940--14030078
40
3.5
40
80
8
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47
7
23
21
1.75
14030045--14030117
24
3.0
24
88
4
103
52
6
23
17
1.69
14039204--14039347
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2.9
49
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4
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27
27
19
25
1.99
14039207--14039347
51
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4
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28
27
19
24
1.99
14042403--14042481
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0
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10
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2.1
57
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25
23
12
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1.91
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2.8
49
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26
27
20
25
1.99
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39
2.0
39
100
0
158
34
15
10
40
1.81
14047970--14048086
57
2.1
57
96
0
216
25
23
12
37
1.91
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183
26
27
21
25
1.99
14053252--14053330
39
2.0
39
100
0
158
34
15
10
40
1.81
14053394--14053510
57
2.1
57
96
0
216
25
23
12
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1.91
14055464--14055603
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2.8
49
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4
183
26
27
20
25
1.99
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3.6
45
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10
163
30
27
16
25
1.97
14060724--14060931
51
4.6
46
83
12
227
29
26
17
25
1.98
14066013--14066152
49
2.8
49
82
4
183
26
27
20
25
1.99
14069196--14069274
39
2.0
39
100
0
158
34
15
10
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1.81
14069338--14069454
57
2.1
57
96
0
216
25
23
12
37
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14071420--14071559
49
2.8
49
82
4
183
26
27
20
25
1.99
14074642--14074679
19
2.0
19
85
10
51
44
0
2
52
1.14
14076223--14076250
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2.0
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0
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14
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1.78
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2.4
26
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9
8
43
1.67
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2.0
21
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0
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19
19
21
1.92
14084571--14084608
17
2.2
17
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7
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34
1.43
14091728--14091761
14
2.4
14
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0
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1.90
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2.1
69
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0
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35
7
15
42
1.74
14093938--14094098
69
2.3
69
91
3
234
33
7
14
44
1.74

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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