Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   

This is table  23  of  333  ( 39894 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6771850--6771907
16
3.8
16
81
6
66
67
0
32
0
0.91
6771850--6771901
10
5.3
9
80
17
59
67
0
32
0
0.91
6771850--6771917
27
2.6
27
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9
70
70
0
29
0
0.87
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9
7.7
10
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20
66
78
0
21
0
0.75
6772201--6772262
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8
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14
63
80
0
19
0
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6772189--6772262
18
4.1
19
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21
88
79
0
20
0
0.73
6772800--6773233
17
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17
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14
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11
10
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1.75
6772800--6772990
35
5.6
34
78
9
163
28
14
10
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1.79
6772969--6773033
23
3.0
21
86
11
87
43
7
7
41
1.62
6772969--6773033
21
3.0
20
86
6
76
43
7
7
41
1.62
6772821--6773234
18
24.0
17
67
18
93
31
11
10
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1.74
6772969--6773033
22
2.9
23
86
6
80
43
7
7
41
1.62
6773012--6773068
16
3.5
16
85
7
71
31
8
8
50
1.64
6773061--6773111
16
3.1
16
83
11
50
43
3
7
45
1.51
6773164--6773219
16
3.5
15
77
18
51
28
14
10
46
1.78
6773212--6773258
19
2.3
19
80
20
51
51
8
6
34
1.58
6785058--6785493
128
3.4
131
93
3
744
30
25
16
27
1.97
6785128--6785513
43
9.0
42
73
10
282
30
25
16
27
1.97
6785087--6785513
85
5.0
87
77
7
424
30
25
16
27
1.97
6796410--6796818
107
3.9
107
89
2
594
32
18
18
30
1.95
6808617--6808676
32
1.9
32
96
3
113
43
6
6
43
1.57
6812185--6812413
127
1.8
127
92
0
386
23
18
27
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6813838--6813883
23
2.0
23
84
12
60
45
10
6
36
1.65
6813845--6813889
23
2.0
23
82
8
56
40
13
8
37
1.76
6819962--6820008
24
2.0
24
100
0
94
4
46
34
14
1.64
6822624--6822683
23
2.5
25
82
17
74
55
0
10
35
1.34
6822619--6822682
26
2.5
27
80
14
73
54
1
9
34
1.42
6822803--6822854
3
17.0
3
78
4
50
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3
3
34
1.35
6822815--6822854
16
2.6
16
88
4
55
57
5
5
32
1.42
6822889--6823026
23
6.0
23
71
19
92
55
5
6
32
1.47
6824967--6824996
15
1.9
15
93
6
51
76
0
0
23
0.78
6824967--6825009
16
2.7
16
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13
52
74
0
4
20
1.00
6829728--6829860
10
14.7
9
65
18
53
63
3
3
30
1.27
6829722--6829904
8
21.5
8
69
18
50
69
2
2
25
1.12
6829830--6829915
14
6.4
14
82
15
69
82
1
0
16
0.73
6829821--6829919
10
8.2
13
75
16
58
81
1
0
17
0.74
6829869--6829920
1
52.0
1
88
0
77
94
0
0
5
0.32
6829855--6829920
13
5.2
13
85
3
82
89
0
0
10
0.49
6830341--6830456
8
12.7
9
71
23
66
35
0
2
62
1.09
6830369--6830440
20
4.0
20
72
24
61
36
0
1
62
1.04
6830369--6830520
9
17.0
9
67
22
56
32
1
1
64
1.10
6830429--6830470
20
2.0
21
86
4
59
38
0
2
59
1.10
6830364--6830491
27
4.7
25
74
18
105
35
0
1
63
1.04
6830443--6830489
18
2.8
18
81
15
64
36
0
0
63
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
5.2
29
73
21
105
35
0
2
62
1.07
6830341--6830489
82
1.8
80
84
11
205
35
0
2
62
1.07
6830343--6830520
82
2.2
80
79
10
193
33
1
1
64
1.11
6835118--6835212
44
2.2
44
98
0
181
32
26
14
26
1.95
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56
3.9
54
80
6
226
38
16
14
30
1.88
6835403--6835613
88
2.4
87
85
4
273
33
21
18
26
1.96
6835578--6835718
54
2.6
55
88
3
214
36
20
15
27
1.93
6835637--6835932
121
2.4
125
88
3
431
38
21
13
25
1.90
6835812--6835986
71
2.5
69
84
4
201
33
23
14
28
1.94
6839347--6839481
39
3.4
38
76
10
94
29
27
19
23
1.98
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5
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6
63
61
0
0
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1.9
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9
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9
7
3
79
1.04
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4.2
8
84
0
50
58
2
0
38
1.13
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30
1.9
30
93
6
100
55
6
0
37
1.27
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27
2.0
27
100
0
106
20
33
37
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1.81
6858654--6858700
22
2.2
21
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7
67
17
42
27
12
1.85
6858661--6858702
22
1.9
22
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0
75
19
40
28
11
1.87
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11.2
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42
0
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16
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11
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37
0
0.95
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13.7
3
89
10
64
64
0
35
0
0.94
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6
12.0
6
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8
67
73
0
26
0
0.83
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141
5.9
140
88
5
1168
58
8
6
26
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6859360--6860196
145
5.9
142
87
5
1153
58
8
6
26
1.51
6859884--6859930
14
3.2
14
80
11
58
70
0
2
27
0.99
6859888--6859944
30
1.9
29
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3
87
68
3
3
24
1.21
6860063--6860292
111
2.1
109
84
9
301
58
9
6
26
1.53
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12
5.7
12
70
20
51
70
2
2
24
1.13
6860271--6860345
30
2.8
25
75
21
71
70
2
2
24
1.13
6860176--6860786
146
4.2
147
89
6
858
58
6
6
28
1.48
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540
2.0
542
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7
1517
58
7
6
27
1.50
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13
2.9
12
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8
54
75
8
0
16
1.04
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22
1.9
22
90
9
68
2
23
0
73
0.94
6867102--6867160
27
2.2
27
90
0
100
8
40
30
20
1.82
6868346--6868372
14
1.9
14
100
0
54
18
0
0
81
0.69
6872864--6872896
12
2.8
12
86
13
50
0
18
0
81
0.68
6873615--6873652
15
2.3
18
86
13
55
26
2
7
63
1.35
6873595--6873671
40
1.9
40
81
5
93
29
1
7
61
1.32
6873791--6873856
9
8.0
8
73
17
55
37
0
4
57
1.19
6873793--6873856
16
3.9
17
79
6
69
37
0
4
57
1.19
6873800--6873879
42
2.0
42
82
9
103
33
1
6
58
1.31
6873944--6874004
15
4.1
15
76
16
56
37
3
4
54
1.39
6874072--6874122
21
2.2
24
83
10
63
33
1
0
64
1.05
6874186--6874237
20
2.5
22
76
23
58
26
3
1
67
1.18
6874583--6874623
18
2.4
17
95
4
73
34
0
4
60
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6875870--6875910
14
2.8
15
88
3
57
21
4
0
73
1.02
6876242--6876301
31
1.9
31
86
6
86
70
1
8
20
1.22
6876296--6876340
17
2.6
17
89
6
65
66
0
11
22
1.22
6876301--6876355
18
3.1
18
86
5
67
61
0
12
25
1.31
6876423--6876699
14
19.9
14
67
20
68
62
2
6
28
1.33
6876421--6876834
3
137.7
3
71
12
235
61
2
7
28
1.35
6876656--6876717
32
1.9
33
86
3
90
64
3
6
25
1.33
6881845--6881899
24
2.4
22
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11
83
16
3
14
65
1.41
6883276--6883344
16
4.2
16
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3
129
24
0
37
37
1.56
6883276--6883344
33
2.1
32
97
2
129
24
0
37
37
1.56
6883325--6883415
45
2.0
45
85
2
121
27
6
28
37
1.82
6883560--6883614
15
3.4
16
80
16
53
54
1
0
43
1.10
6883566--6883614
16
2.9
18
80
20
61
55
0
0
44
0.99
6883662--6883874
67
3.1
67
65
20
163
46
4
3
46
1.38
6883467--6883794
156
2.1
156
97
0
611
42
3
6
46
1.47
6883736--6883770
18
2.0
17
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5
52
54
0
0
45
0.99
6883873--6883907
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
6883653--6883927
137
2.0
137
95
1
498
46
4
3
46
1.39
6892356--6892403
20
2.3
20
82
3
69
27
14
10
47
1.76
6899928--6899958
15
2.1
15
93
0
53
41
6
22
29
1.78
6901388--6901421
12
2.8
12
90
0
59
58
0
8
32
1.29
6906195--6906323
44
2.9
45
85
6
181
27
18
7
45
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6909616--6909720
47
2.2
47
91
0
165
25
15
26
32
1.95
6918076--6918122
23
2.0
23
100
0
94
14
29
4
51
1.62
6921826--6921869
19
2.3
19
80
0
52
50
0
0
50
1.00
6934093--6934121
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1.9
15
100
0
58
27
17
0
55
1.42
6935368--6935410
17
2.5
18
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7
54
37
0
4
58
1.19
6944618--6944870
73
3.5
72
92
4
402
31
18
17
32
1.94
6944804--6945048
88
2.8
88
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298
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20
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27
1.95
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6
506
33
20
15
31
1.93
6945269--6945686
151
2.8
149
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7
513
33
20
15
31
1.93
6945704--6945872
72
2.4
69
88
3
230
35
27
14
22
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333