Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  121  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39140009--39140055
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1.04
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2.0
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4
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0
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0
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65
0
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1.27
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2.0
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1.97
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2.0
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1.97
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4.7
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2.00
39211049--39211233
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4.7
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25
27
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2.00
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5
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4
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18
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30
1.98
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49
2.7
49
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9
135
21
25
22
30
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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3.2
30
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27
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1.96
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17
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1.95
39231097--39231242
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2.00
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80
2.2
80
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2.00
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2.0
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2.0
20
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2.0
20
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15
53
39
23
0
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1.55
39256636--39256757
46
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46
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174
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1.98
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45
2.7
46
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5
198
30
27
21
21
1.98
39264134--39264273
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3.1
45
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144
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28
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21
1.98
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28
28
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23
1.99
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1.8
88
88
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27
29
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2.0
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1.9
14
100
0
54
14
7
7
70
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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2.0
23
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12
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1.25
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24
2.2
25
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11
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10
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0
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7
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1.18
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10
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39326157--39326210
11
4.7
11
91
8
90
14
1
7
75
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39326156--39326211
12
4.8
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14
1
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2.7
30
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13
21
1
63
1.35
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2.7
12
95
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9
15
3
71
1.24
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5
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1
16
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1
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54
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8
52
1.61
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21
2.0
22
86
4
63
29
6
29
34
1.83
39338302--39338353
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2.3
22
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21
54
9
23
1
65
1.32
39340754--39340781
4
7.0
4
100
0
56
75
0
0
25
0.81
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4
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4
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7
53
76
0
0
23
0.78
39345330--39345419
29
3.1
29
85
1
110
30
26
14
28
1.95
39347425--39347473
20
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21
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24
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1.98
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20
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20
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0
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18
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20
1.96
39355277--39355320
22
2.0
22
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0
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1.76
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12
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22
2.0
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39366410--39366441
12
2.7
12
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0
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18
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0
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27
2.3
27
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12
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12
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19
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8
17
3
70
1.25
39366425--39366483
14
4.3
14
74
16
52
10
16
1
71
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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6
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6
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21
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0
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2.1
12
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0
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0
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1.02
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21
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0
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3
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5
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4
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9
1.23
39370864--39370914
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1.14
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2
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2
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2
0.99
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100
0
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30
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26
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10
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1.74
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21
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33
33
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29
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6
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0
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62
0
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19
2.1
19
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0
53
25
35
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1.95
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30
1.9
28
85
7
76
12
30
3
53
1.55
39397679--39397715
16
2.3
16
100
0
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59
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5
16
1.55
39399816--39399844
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11
100
0
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0
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0
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2.9
14
85
3
57
73
2
21
2
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39406222--39406318
30
3.2
30
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15
26
28
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15
3.3
15
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53
31
0
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1.55
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29
2.1
29
90
0
93
30
0
28
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2.3
27
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30
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2
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27
27
15
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2.1
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154
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1
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56
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1
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1.25
39435190--39435236
20
2.3
20
81
0
58
29
34
12
23
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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