Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  309  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101286969--101286997
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14
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0
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58
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10
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77
4
0
18
0.94
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1.9
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10
57
65
0
5
30
1.14
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0
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0
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35
1
0
62
1.06
101321235--101321330
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56
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9
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30
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2.6
13
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4
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12
0
39
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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28
26
28
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1.9
29
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1.66
101350983--101351188
7
29.6
7
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1.64
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24
20
28
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2.0
220
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20
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51
0
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2.3
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32
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1.72
101375773--101375819
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2.2
22
85
11
62
44
2
6
46
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
1.87
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15
2.5
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5
43
1.40
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3.2
16
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30
0
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34
1.58
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2.0
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2
119
32
5
27
34
1.80
101385588--101385624
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51
0
0
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0
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4
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1.02
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9
11
1.07
101390552--101390630
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1.09
101390551--101390630
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10
10
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1.65
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1.8
110
82
7
259
29
15
20
34
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101411788--101411873
5
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5
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54
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27
1.43
101411781--101411817
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2.2
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10
24
1.25
101411774--101411817
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58
63
0
11
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1.27
101411788--101411873
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3.5
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14
85
54
0
17
27
1.43
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13
17
1.38
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61
1
18
18
1.41
101411959--101412034
11
7.3
10
81
12
91
61
1
18
18
1.41
101422356--101422396
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
101432417--101432446
15
2.1
15
93
6
53
83
10
6
0
0.81
101438027--101438063
2
18.5
2
94
0
65
2
0
45
51
1.15
101438187--101438235
9
5.4
9
82
7
55
24
34
0
40
1.55
101441061--101441158
23
4.3
23
90
2
162
31
26
21
20
1.98
101441068--101441156
45
2.0
45
95
0
160
31
26
22
19
1.97
101448341--101448395
19
2.8
19
84
13
76
27
16
7
49
1.72
101449587--101449620
14
2.4
14
95
0
59
23
32
14
29
1.94
101450117--101450342
47
4.9
48
70
10
173
28
24
20
26
1.99
101452008--101452053
25
1.9
25
82
8
60
28
15
2
54
1.53
101452315--101452496
46
4.0
46
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1
222
21
23
14
40
1.90
101468087--101468122
18
2.0
18
100
0
72
11
11
27
50
1.72
101468091--101468129
18
2.2
18
86
4
53
12
15
20
51
1.76
101469635--101469670
3
12.0
3
93
0
63
66
2
0
30
1.06
101469744--101469827
21
4.0
21
77
16
70
65
0
7
27
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101469770--101469815
24
1.9
24
86
8
67
63
0
6
30
1.20
101469817--101469858
17
2.5
17
82
17
52
71
0
11
16
1.14
101469889--101469924
15
2.4
15
90
0
54
66
0
2
30
1.06
101469880--101469928
19
2.5
20
80
3
55
67
0
2
30
1.02
101471959--101472097
44
3.2
44
74
6
129
30
19
20
28
1.97
101472185--101472330
50
2.9
51
73
11
147
34
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19
26
1.96
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2.0
44
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0
127
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20
26
1.96
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44
2.2
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5
112
32
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21
33
1.91
101472907--101472958
24
2.2
24
100
0
104
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25
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1.72
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24
2.0
24
88
8
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12
27
2
58
1.46
101483086--101483137
23
2.3
23
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3
0
44
1.19
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1.9
16
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0
53
41
0
3
54
1.16
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12
2.5
12
94
0
51
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0
26
0
0.84
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23
2.0
23
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11
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39
1.74
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16
1.9
16
93
0
53
41
0
3
54
1.16
101494098--101494127
12
2.5
12
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0
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0
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0
0.84
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18
2.6
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10
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36
23
8
30
1.85
101506416--101506475
21
2.9
21
82
0
75
36
20
5
38
1.74
101508881--101508931
22
2.3
22
79
0
57
68
3
1
25
1.17
101509035--101509094
28
2.1
27
84
6
75
65
5
3
26
1.29
101509035--101509095
26
2.2
28
82
8
72
63
4
3
27
1.30
101509429--101509465
13
2.8
13
87
0
56
32
0
0
67
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101511369--101511500
61
2.2
61
97
0
246
36
20
9
33
1.86
101520872--101520899
12
2.3
12
100
0
56
53
0
14
32
1.41
101521611--101521647
19
2.0
18
89
5
56
29
5
2
62
1.31
101525343--101525419
27
2.9
27
86
9
113
37
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23
16
1.94
101525855--101525896
21
2.0
21
85
0
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0
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1.57
101525866--101525898
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3.1
11
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8
50
33
36
0
30
1.58
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5.5
6
100
0
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33
0
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21
1.94
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36
2.1
36
100
0
148
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2
24
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1.68
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30
1.9
30
92
0
96
29
14
17
38
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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