Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  15  of  333  ( 39894 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4359741--4359812
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65
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182
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2
6
49
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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36
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236
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37
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
23
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2.00
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25
23
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1.9
188
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3
486
37
19
16
27
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4464384--4464462
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2.1
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21
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0
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17
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57
1.64
4508626--4508713
30
3.0
30
83
8
108
11
17
14
56
1.66
4523999--4524050
26
2.0
27
85
11
72
17
0
13
69
1.19
4524171--4524230
24
2.6
24
78
5
70
63
0
5
31
1.16
4524171--4524237
22
3.0
22
71
6
62
62
0
4
32
1.15
4526415--4526450
19
1.9
18
88
5
54
5
11
11
72
1.28
4526879--4526944
20
3.3
20
80
0
78
13
15
12
59
1.62
4526920--4526977
24
2.5
24
86
8
75
8
10
10
70
1.34
4527178--4527294
20
5.6
20
70
12
74
19
23
7
49
1.74
4529705--4529967
40
6.6
40
88
3
325
24
20
27
26
1.99
4529744--4530002
80
3.3
80
85
3
256
25
20
27
25
1.99
4533852--4533886
16
2.1
17
89
10
54
65
5
25
2
1.28
4536018--4536139
60
2.0
60
95
0
217
33
13
19
32
1.91
4538442--4538484
15
2.8
15
80
13
52
51
0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4540474--4540525
24
2.2
24
89
0
77
55
9
1
32
1.43
4542445--4542496
24
2.2
24
89
0
77
55
9
1
32
1.43
4543966--4544007
22
1.9
22
90
0
66
47
11
0
40
1.40
4547162--4547216
27
2.1
26
82
3
65
60
1
3
34
1.25
4548081--4548114
6
5.3
6
86
13
50
82
2
0
14
0.79
4548799--4548826
14
2.0
14
100
0
56
64
0
0
35
0.94
4554128--4554187
31
1.9
31
86
0
84
38
13
6
41
1.70
4558625--4558652
12
2.3
12
100
0
56
92
0
7
0
0.37
4566310--4566347
20
1.9
20
88
0
58
60
0
0
39
0.97
4566934--4566982
24
2.0
24
84
7
64
40
6
2
51
1.38
4567330--4567370
22
1.9
21
85
5
55
17
2
9
70
1.25
4570128--4570165
20
1.9
20
84
10
51
31
5
2
60
1.33
4572930--4572959
10
2.9
10
95
5
51
26
20
3
50
1.64
4575163--4575187
11
2.3
11
100
0
50
16
0
0
84
0.63
4598635--4598687
16
3.2
17
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15
58
60
1
20
16
1.45
4599709--4599737
15
1.9
15
100
0
58
55
10
6
27
1.59
4602221--4602334
60
1.9
59
85
7
158
35
10
18
35
1.85
4604103--4604149
17
2.9
16
76
14
51
21
2
2
74
1.03
4606820--4606879
22
2.7
23
73
19
63
66
6
0
26
1.16
4606829--4606862
4
8.0
4
90
9
50
73
2
0
23
0.97
4608211--4608262
23
2.3
22
75
15
52
9
21
1
67
1.29
4610640--4610699
22
2.7
23
73
19
63
66
6
0
26
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4610649--4610682
4
8.0
4
90
9
50
73
2
0
23
0.97
4616460--4616522
24
2.5
26
85
10
78
58
4
3
33
1.35
4616752--4616807
28
2.0
28
82
6
69
57
3
10
28
1.49
4616761--4616846
28
3.1
27
72
18
70
55
2
9
32
1.44
4619353--4619383
7
4.4
7
91
0
53
35
3
0
61
1.12
4619512--4619545
17
1.9
18
94
5
61
17
2
8
70
1.25
4632885--4632939
27
2.0
27
86
6
76
47
7
7
38
1.59
4636523--4636854
135
2.5
135
84
1
423
27
23
20
28
1.99
4636803--4636922
44
2.7
44
92
0
195
25
25
23
25
2.00
4644666--4644709
20
2.1
21
87
4
63
15
22
22
38
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333