Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  266  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Copy
Number
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Indels
Score
A
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Period
Size
Copy
Number
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Score
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2.5
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91
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38
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
88184903--88185005
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20
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0
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2.6
22
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17
72
37
0
0
62
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17.0
3
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66
0
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0
0.92
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5
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5
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57
18
0
0
81
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9
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19
0
0
80
0.71
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48
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7
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14
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28
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88219832--88220100
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2.7
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0
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28
1.93
88220064--88220172
37
3.0
37
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2
177
35
16
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24
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88222262--88222313
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5
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4
97
19
0
0
80
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11
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0
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7
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1.26
88223305--88223365
23
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1
0
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0
0
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1.9
126
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425
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1.89
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13
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0
4
28
1.08
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0
0
32
0.91
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19
2.0
18
94
5
65
67
0
0
32
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.34
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18
2.0
18
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0
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37
2.0
37
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141
17
0
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1.44
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29
2.2
29
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5
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17
1
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30
1.55
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21
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1.99
88231316--88231877
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4
513
22
24
21
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1.98
88231844--88232351
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3.8
132
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24
21
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31
1.99
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2.5
178
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1.99
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24
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0
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6
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0
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18
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18
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0
16
1
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0.74
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15
2.7
15
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0
17
0
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35
2.1
35
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0
16
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0
16
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2.0
461
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88236942--88236986
21
2.1
21
87
0
63
15
26
22
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126
1.8
126
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0
431
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16
30
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0
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28
1.08
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15
4.1
14
80
6
59
59
3
0
37
1.14
88241194--88241325
59
2.2
59
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10
162
62
6
4
26
1.38
88241600--88241671
18
3.9
18
71
16
67
18
0
54
27
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88241614--88241691
37
2.1
38
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2
149
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0
52
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1.45
88241654--88241710
29
2.0
29
92
0
96
17
0
47
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1.48
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2.2
33
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0
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17
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2.4
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0
70
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0
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19
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0
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0
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0
0
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19
16
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1.84
88258209--88258398
42
4.5
41
79
5
184
17
19
16
46
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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