Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   

This is table  106  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33988652--33988707
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3
0
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33988655--33988708
23
2.3
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2.00
34027159--34027408
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26
26
23
24
2.00
34032435--34032659
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23
2.00
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0
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1
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1.11
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51
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2.0
44
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4
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2.0
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5
7.6
5
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2
60
38
0
20
41
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
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5
22
0
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2.0
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16
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2.3
20
100
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1.71
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3
94
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17
2.0
17
100
0
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0
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127
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915
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16
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1.94
34153359--34153952
253
2.4
252
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5
917
34
20
16
28
1.94
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16
1.9
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6
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3
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0
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0
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0
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50
40
0
1
58
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81
13
79
46
0
0
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1.00
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0
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7
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100
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14
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160
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16
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2.0
45
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0
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26
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16
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18
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50
80
3
440
30
25
17
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
25
1.97
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2.6
151
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0
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30
25
17
25
1.98
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2.3
20
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10
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0
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1.44
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30
2.0
30
82
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27
27
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2.3
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137
28
27
17
26
1.98
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2.2
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23
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23
2.0
23
100
0
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22
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1.98
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20
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1.98
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93
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21
28
28
1.98
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20
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29
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29
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11
127
25
14
34
25
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
34238641--34238775
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1.93
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2.7
16
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0
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16
18
13
1.77
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11
127
27
13
34
24
1.93
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46
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17
25
1.97
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17
24
1.97
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27
27
1.99
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80
2.2
80
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243
24
21
27
27
1.99
34262026--34262075
25
2.0
25
88
7
75
40
20
0
40
1.52
34267906--34267981
40
1.9
40
86
0
107
32
31
15
19
1.94
34271893--34271953
10
6.1
10
74
12
54
32
13
24
29
1.93
34271894--34271954
20
3.0
20
83
9
79
32
13
26
27
1.93
34273975--34274037
33
1.9
33
84
12
85
12
25
6
55
1.60
34274035--34274090
21
2.7
21
72
5
51
8
17
1
71
1.21
34274034--34274090
14
4.1
14
75
16
57
8
17
1
71
1.19
34274052--34274141
6
14.7
6
69
11
58
5
17
3
73
1.17
34275159--34275184
10
2.6
10
100
0
52
0
7
0
92
0.39
34275326--34275356
11
2.7
12
95
5
55
6
3
6
83
0.88
34276612--34276672
10
6.1
10
74
12
54
32
13
24
29
1.93
34276613--34276673
20
3.0
20
83
9
79
32
13
26
27
1.93
34281375--34281698
42
7.3
41
75
15
227
30
25
15
28
1.96
34281490--34281681
48
4.0
48
87
2
271
29
23
15
30
1.96
34281688--34281845
37
4.3
37
89
2
203
27
27
16
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
34284324--34284400
28
2.8
28
81
0
100
29
27
11
31
1.92
34291403--34291582
48
3.7
48
80
5
184
25
21
30
22
1.99
34293136--34293304
46
3.7
44
74
11
142
22
26
20
30
1.98
34293131--34293304
94
1.9
91
82
9
217
22
27
21
29
1.99
34302202--34302266
32
2.0
32
100
0
130
43
18
12
26
1.85
34302804--34302848
22
2.0
22
83
8
56
37
4
0
57
1.19
34305068--34305150
43
1.9
43
87
4
123
21
20
31
26
1.98
34305966--34306020
18
3.2
18
68
19
53
20
9
27
43
1.81
34305950--34306020
34
2.1
34
91
0
115
19
11
26
42
1.85
34310286--34310325
21
1.9
21
100
0
80
35
5
30
30
1.79
34319568--34319601
18
1.9
18
94
5
61
38
11
5
44
1.65
34321528--34321651
48
2.6
48
90
0
185
24
17
32
25
1.97
34325139--34325441
47
6.4
47
93
3
486
27
31
7
33
1.85
34325139--34325441
96
3.2
96
94
2
508
27
31
7
33
1.85
34325343--34325418
22
3.3
22
66
16
64
25
31
11
31
1.91
34325139--34325441
143
2.1
140
92
4
493
27
31
7
33
1.85
34333057--34333140
28
3.0
28
87
1
114
20
3
28
47
1.66
34333345--34333430
23
4.0
23
72
18
85
17
19
24
38
1.93
34333344--34333430
21
4.1
21
73
7
77
18
19
24
37
1.94
34334511--34334697
46
3.9
48
75
15
163
25
15
28
29
1.96
34342937--34343062
48
2.6
48
89
0
189
23
16
32
27
1.96
34347003--34347047
16
2.7
17
83
13
58
75
0
17
6
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
34346992--34347046
22
2.5
20
78
18
56
74
0
18
7
1.04
34348143--34348187
10
4.4
10
80
5
54
13
22
22
42
1.88
34348140--34348188
21
2.4
20
86
3
62
12
20
22
44
1.84
34355927--34356099
94
1.8
94
83
2
231
28
18
27
24
1.98
34355888--34356243
46
7.5
48
73
13
181
27
19
28
24
1.99
34355981--34356243
142
1.9
139
84
7
352
26
19
28
25
1.99
34365247--34365369
43
2.9
44
75
11
130
26
17
23
31
1.97
34374856--34374900
14
3.3
14
78
6
56
35
0
15
48
1.45
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29
2.0
29
93
0
98
43
29
0
27
1.55
34375883--34375930
15
3.3
15
73
5
53
43
27
0
29
1.55

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333