Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  303  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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35
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3
12.3
3
88
5
58
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2
2
34
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.1
22
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292
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1.9
27
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104
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21
25
30
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99939066--99940876
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2.3
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0
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1.25
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1.9
22
81
9
52
38
6
2
52
1.41
99954326--99954376
15
3.4
15
86
5
59
52
1
0
45
1.12
99960532--99960573
20
2.1
20
100
0
84
59
19
4
16
1.54
99960718--99960759
14
2.9
15
86
10
61
47
0
7
45
1.30
99961772--99961807
18
2.1
18
89
5
56
72
0
0
27
0.85
99962060--99962154
18
4.7
21
79
12
74
40
16
7
35
1.77
99962060--99962117
22
2.6
22
81
7
64
41
17
5
36
1.72
99962096--99962169
19
3.9
19
96
3
141
36
16
10
36
1.83
99962089--99962169
37
2.2
38
91
8
141
35
17
9
37
1.83
99962099--99962178
37
2.2
37
88
6
110
38
13
12
35
1.83
99962516--99962789
45
6.1
45
77
6
259
25
27
15
31
1.95
99962516--99962699
89
2.1
90
87
1
262
25
28
14
32
1.94
99962729--99963023
78
3.8
78
93
1
493
24
24
19
31
1.98
99963104--99963713
78
7.6
78
86
6
819
24
23
18
33
1.97
99963050--99963713
248
2.7
239
84
7
858
25
23
18
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99963655--99964220
220
2.6
220
90
0
871
27
20
18
33
1.96
99972872--99972929
22
2.6
22
81
7
64
41
17
5
36
1.72
99972899--99972946
19
2.5
19
75
25
55
33
16
8
41
1.78
99972911--99972988
36
2.2
36
88
9
115
37
12
12
37
1.82
99972908--99972980
19
3.9
19
92
7
132
35
15
10
38
1.82
99973099--99973137
21
1.9
20
84
5
51
10
2
15
71
1.23
99979796--99979843
17
2.7
19
75
12
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56
0
0
43
0.99
99979796--99979843
19
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0
0
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13
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0
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0
8
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1.32
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8
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0
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34
0
27
1.57
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13
1.9
13
100
0
50
44
0
8
48
1.32
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2.9
30
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15
27
32
23
1.95
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35
3.2
35
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2
120
40
32
9
16
1.81
100017961--100018025
23
2.8
23
90
0
94
10
6
36
46
1.64
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43
2.5
42
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6
115
34
29
16
19
1.93
100025704--100025739
18
2.0
18
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8
0
27
1.23
100025640--100025718
3
26.7
3
75
21
51
70
3
2
22
1.15
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16
3.9
16
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12
76
69
0
3
26
1.03
100025905--100025956
22
2.5
20
82
11
68
73
3
0
23
1.00
100030154--100030214
30
2.0
30
83
0
77
13
24
34
27
1.93
100033569--100033593
13
1.9
13
100
0
50
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0
28
1.41
100036140--100036179
21
1.9
21
100
0
80
22
15
35
27
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100036372--100036420
22
2.2
23
85
10
66
63
0
12
24
1.29
100037762--100037816
26
2.1
27
82
3
67
63
9
9
18
1.49
100041832--100041889
21
2.8
21
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23
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41
0
3
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1.17
100042606--100042740
39
3.4
39
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123
23
20
27
28
1.99
100048489--100048544
12
4.3
13
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0
3
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109
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20
25
30
1.99
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4.9
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1.98
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0
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25
23
1.92
100068821--100068896
25
3.2
25
62
27
65
35
17
25
22
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333