Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  106  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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152
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24
27
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33253238--33253276
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0
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0
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82
28
8
5
57
1.50
33266958--33267658
118
6.0
117
93
4
1130
33
17
18
30
1.94
33281183--33281884
119
5.8
119
89
2
994
34
16
18
31
1.93
33281167--33281886
241
3.0
241
92
1
1171
34
16
18
31
1.93
33283665--33283717
20
2.8
20
83
11
67
37
3
0
58
1.16
33284093--33284125
7
4.7
7
100
0
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42
0
0
57
0.98
33284325--33284383
30
2.0
30
86
0
82
28
8
5
57
1.50
33285634--33285687
23
2.3
24
75
15
60
18
1
16
62
1.41
33285972--33286294
127
2.5
127
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0
421
25
16
21
37
1.93
33288738--33288900
54
3.0
55
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20
135
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2
3
31
1.26
33288753--33288868
5
23.2
5
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1
2
32
1.19
33289250--33289320
30
2.4
30
100
0
142
11
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12
1.79
33290536--33290960
45
9.1
45
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15
195
27
27
13
31
1.94
33290628--33290733
52
2.0
52
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0
194
22
31
15
31
1.95
33290536--33290825
142
2.0
142
89
0
445
26
27
14
32
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33290678--33290914
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2.6
90
90
0
366
27
27
13
32
1.93
33290519--33290960
232
1.9
232
90
0
706
27
27
13
31
1.94
33290860--33291018
52
3.0
52
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6
187
27
28
11
33
1.91
33301172--33301237
33
2.0
33
100
0
132
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30
15
36
1.91
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3
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3
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24
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0
2
35
1.11
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7
23.4
7
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1
3
32
1.17
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21
5.0
21
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0
2
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1.17
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33
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0
2
34
1.09
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29
5.8
29
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16
118
63
1
2
32
1.17
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21
5.6
23
69
25
57
62
0
2
35
1.09
33303046--33303224
32
5.8
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71
21
119
63
1
2
32
1.19
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28
4.7
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18
106
63
1
2
33
1.15
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11
3.0
11
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4
50
67
0
2
29
1.05
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19
2.1
19
86
9
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25
20
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1.86
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17
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18
86
5
216
37
14
11
36
1.82
33312547--33312697
35
4.2
35
94
2
257
37
13
11
36
1.82
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22
2.0
22
100
0
88
36
13
18
31
1.90
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207
4.3
207
93
0
1399
29
22
17
30
1.97
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2.4
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79
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223
21
22
24
30
1.99
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1
71.0
1
74
0
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1
11
0
87
0.61
33315287--33315357
7
9.7
7
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11
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1
11
0
87
0.61
33315287--33315357
23
3.2
22
84
15
94
1
11
0
87
0.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33315293--33315357
16
4.2
16
84
5
82
1
10
0
87
0.61
33316754--33316778
8
3.1
8
100
0
50
0
12
0
88
0.53
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44
2.6
44
85
2
149
35
13
22
27
1.92
33320046--33320179
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
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18
2.2
18
100
0
78
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15
28
20
1.93
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44
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44
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2
149
35
13
22
27
1.92
33327413--33327546
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
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1.93
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1.81
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4.2
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2
248
38
13
11
36
1.81
33334699--33334794
44
2.2
46
81
9
110
33
15
22
28
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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