Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  225  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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67745256--67745525
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220
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33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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G
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2.1
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17
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1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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53
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23
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67865550--67865610
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69
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6
176
31
14
20
32
1.93
67876308--67876415
34
3.1
33
71
18
94
32
12
15
39
1.84
67881237--67881324
45
2.0
45
86
0
122
48
5
18
27
1.70
67884586--67884615
12
2.5
12
100
0
60
46
33
0
20
1.51
67889691--67889739
25
2.0
25
83
0
62
36
6
14
42
1.70
67895289--67895726
50
8.9
50
86
5
545
28
18
30
23
1.97
67896904--67896941
2
19.0
2
100
0
76
50
0
0
50
1.00
67899477--67899616
71
2.0
70
94
1
244
36
20
10
32
1.87
67900611--67900664
28
1.9
28
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0
99
42
16
7
33
1.76
67904097--67904266
46
3.7
45
78
12
159
21
29
21
28
1.98
67904003--67904271
46
5.8
44
74
15
136
23
30
18
27
1.98
67907730--67907947
40
5.5
40
88
4
293
22
23
28
25
1.99
67915861--67916064
40
5.1
40
89
4
281
21
24
29
25
1.99
67917558--67917587
9
3.2
9
95
4
51
66
30
0
3
1.07
67918197--67918355
43
3.7
43
74
12
155
31
25
15
27
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67920391--67920436
20
2.4
18
82
7
56
28
2
4
65
1.23
67920391--67920436
9
4.9
9
79
10
56
28
2
4
65
1.23
67920422--67920467
21
2.2
21
88
3
67
41
2
4
52
1.33
67925074--67925159
43
2.0
43
95
0
154
32
18
16
32
1.93
67927542--67927753
41
5.2
41
74
6
162
23
28
13
34
1.93
67927542--67927753
82
2.6
81
78
3
219
23
28
13
34
1.93
67950111--67950148
20
1.9
20
100
0
76
15
31
31
21
1.94
67950687--67950722
13
2.7
13
86
4
54
52
13
0
33
1.41
67952308--67952368
3
20.0
3
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113
67
0
0
32
0.91
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3
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3
95
0
79
36
0
0
63
0.95
67965372--67965485
35
3.3
35
80
4
131
27
10
20
42
1.84
67967174--67967303
40
3.2
40
83
4
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23
29
25
22
1.99
67975154--67975283
40
3.2
40
83
4
165
23
29
25
22
1.99
67977252--67977293
20
2.0
21
95
4
77
9
4
28
57
1.51
67982063--67982449
24
16.1
24
98
0
711
20
17
25
36
1.94
67985918--67986040
47
2.7
44
81
14
142
26
17
31
24
1.97
67985961--67986182
47
4.7
48
74
13
158
30
18
29
22
1.97
67993349--67993393
8
5.4
8
82
10
54
62
0
0
37
0.96
67993347--67993393
18
2.8
16
81
12
58
61
0
0
38
0.96
67993349--67993412
5
12.6
5
74
21
53
62
0
1
35
1.05
67993468--67993502
12
2.9
12
95
0
61
77
2
20
0
0.90
67993467--67993514
24
2.0
24
88
8
71
77
2
20
0
0.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68006987--68007073
6
14.7
6
79
7
97
19
3
0
77
0.92
68012206--68012604
47
8.4
48
93
2
628
31
8
31
29
1.87
68012235--68012317
27
3.3
27
60
16
68
31
4
30
33
1.79
68012206--68012604
143
2.8
143
93
1
658
31
8
31
29
1.87
68014472--68014496
13
1.9
13
100
0
50
44
0
8
48
1.32
68014735--68014815
26
3.2
25
75
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83
19
17
19
43
1.89
68019977--68020094
22
5.3
23
84
6
145
33
17
21
27
1.96
68019977--68020119
45
3.2
44
81
11
157
34
17
20
27
1.95
68025934--68026117
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
68025974--68026162
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335