Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  8  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2757432--2757465
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1.9
17
88
5
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79
2
8
8
1.03
2757442--2757519
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2.4
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79
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3
21
3
1.20
2757442--2757526
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3
22
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1.18
2758605--2758731
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2.2
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12
170
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1
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1.57
2758870--2758994
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18
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7
92
36
16
12
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1.86
2759110--2759218
45
2.3
46
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19
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7
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16
16
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0
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0
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2.0
20
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2.0
21
90
0
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0
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0
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9
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10
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0
0
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0
0
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1.00
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2.5
16
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8
55
65
0
35
0
0.93
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44
2.7
45
82
5
140
33
14
23
28
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2790925--2791018
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2.1
45
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0
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19
19
20
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1.91
2791198--2791315
18
6.6
18
68
13
55
35
11
16
35
1.86
2791186--2791315
36
3.6
36
72
10
104
36
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16
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2.0
45
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2.2
20
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0
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0
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30
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20
1.98
2818187--2818362
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3.8
46
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10
232
28
29
21
20
1.98
2819509--2819700
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3.6
53
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8
210
21
24
18
35
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2819898--2819984
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2.0
44
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122
24
26
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14
14
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0
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28
2
0
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1.01
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0
0
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0
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1.9
18
88
0
52
37
2
11
48
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2839378--2839434
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2.7
20
74
20
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52
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0
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0
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1.00
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18
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0
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2
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2.2
23
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24
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17
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0
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0.90
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14
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17
4
0
78
0.91
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29
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5
0
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2.2
30
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70
1.14
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10
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11
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11
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88
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11
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11
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16
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0
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54
1.16
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1.12
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2.5
23
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13
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11
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15
2.0
15
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6
51
68
0
0
31
0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2883143--2883201
27
2.1
28
82
14
70
61
1
0
37
1.07
2885008--2885057
15
3.3
15
75
10
57
22
36
2
40
1.65
2885008--2885073
30
2.2
29
81
10
71
24
36
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1.71
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0
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2.0
30
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40
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0
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14
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2.0
22
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0
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9
18
1.57
2932991--2933028
13
2.9
13
81
11
51
39
2
2
55
1.28
2933031--2933083
22
2.5
22
81
6
65
60
0
3
35
1.15
2934652--2934716
29
2.3
28
84
7
78
47
1
1
49
1.20
2934670--2934734
29
2.2
29
81
10
71
50
1
1
46
1.20
2946814--2946874
30
2.0
30
93
0
104
44
18
14
22
1.86
2949887--2949917
15
2.0
16
93
6
55
19
9
19
51
1.74
2956206--2956295
43
2.1
43
100
0
180
43
7
17
31
1.78
2960162--2960206
18
2.4
18
85
7
54
37
0
0
62
0.96
2970253--2970318
31
2.1
31
86
5
89
34
3
1
60
1.21
2970253--2970318
15
4.3
15
77
12
71
34
3
1
60
1.21
2970282--2970326
23
2.0
22
83
12
56
31
2
0
66
1.04
2970300--2970375
30
2.5
30
82
6
82
39
0
3
56
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2971351--2971413
30
2.1
30
94
5
110
26
3
12
57
1.51
2971540--2971572
11
2.9
12
86
13
52
66
0
0
33
0.92
2974673--2974777
26
4.1
26
91
2
176
32
4
25
37
1.77
2974673--2974777
51
2.0
52
96
1
194
32
4
25
37
1.77
2977489--2977526
19
2.0
20
84
5
51
26
5
0
68
1.11
2977771--2977813
22
2.0
21
86
9
59
72
2
11
13
1.22
2977959--2978026
29
2.3
29
94
0
118
51
8
8
30
1.63
2978966--2979065
48
2.1
48
88
3
148
36
25
7
32
1.83
2979341--2979387
21
2.2
21
85
11
60
38
0
0
61
0.96
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23
2.0
23
87
8
67
36
0
0
63
0.95
2979895--2979934
21
1.9
21
85
10
55
57
10
5
27
1.52
2981063--2981104
21
2.0
20
86
4
57
61
7
0
30
1.22
2989914--2989968
18
3.1
18
79
10
51
50
1
3
43
1.30
2989970--2990005
18
2.0
18
100
0
72
44
5
11
38
1.63
3003698--3003794
36
2.7
36
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6
124
22
19
31
25
1.98
3006917--3006952
5
7.0
5
93
6
63
61
0
0
38
0.96
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46
2.1
47
82
8
118
30
27
15
26
1.96
3009943--3010055
25
4.5
25
87
4
147
37
19
22
21
1.95
3016194--3016257
32
2.0
32
100
0
128
31
18
6
43
1.75
3033827--3033859
13
2.6
13
90
4
50
39
0
12
48
1.40
3035148--3035262
44
2.6
44
85
2
149
35
13
22
27
1.92
3035148--3035281
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3039579--3039616
16
2.4
16
90
0
58
63
2
7
26
1.35
3041335--3041369
15
2.4
14
90
4
52
2
0
17
80
0.84
3041588--3042605
44
23.1
44
87
1
1315
26
31
15
27
1.96
3042837--3043724
132
6.8
132
90
2
1145
27
25
18
29
1.98
3043231--3043699
45
10.6
45
64
11
148
26
23
18
30
1.98
3044902--3045127
97
2.3
98
95
1
400
11
16
13
58
1.63
3045656--3045700
15
3.1
15
87
12
60
0
17
0
82
0.68
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15
2.8
16
89
10
61
0
21
0
78
0.76
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24
1.9
24
95
0
83
45
15
17
21
1.85
3048622--3048746
46
2.7
46
92
0
196
20
20
28
30
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335