Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  32  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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34
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
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0.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Indels
Score
A
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(0-2)
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86
45
1
22
30
1.62
11984899--11984953
29
2.0
28
82
13
69
43
0
3
52
1.18
11986637--11986774
40
3.5
40
79
2
152
32
10
19
36
1.87
11987141--11987180
21
1.9
21
94
0
71
42
17
27
12
1.85
11999012--11999038
3
9.0
3
100
0
54
66
0
33
0
0.92
12001115--12001140
13
2.0
13
100
0
52
30
7
30
30
1.85
12007732--12007765
15
2.2
16
94
5
61
38
17
11
32
1.86
12007865--12007925
27
2.3
27
88
2
97
70
3
3
22
1.17
12007865--12007924
9
6.9
8
75
20
50
70
3
3
23
1.18
12007875--12007924
9
5.4
9
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11
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70
4
2
24
1.15
12009137--12009287
53
2.8
53
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29
27
16
25
1.97
12010854--12010977
57
2.2
54
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11
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30
7
3
58
1.41
12010966--12011036
29
2.5
28
82
8
74
39
0
0
60
0.97
12011022--12011067
9
5.4
9
92
7
71
10
6
0
82
0.83
12011903--12011943
15
2.7
15
85
14
57
75
0
0
24
0.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12011909--12011943
5
7.0
5
90
9
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77
0
0
22
0.78
12021553--12021587
16
2.2
16
100
0
70
17
11
17
54
1.71
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2
18.0
2
100
0
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50
0
0
50
1.00
12035783--12035822
21
1.9
21
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0
71
27
17
25
30
1.97
12035873--12035914
3
14.0
3
100
0
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0
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0
0.92
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13
2.7
13
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0
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28
8
20
42
1.81
12036534--12036601
19
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19
78
13
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51
0
1
47
1.09
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8
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51
0
13
0
86
0.57
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17
2.3
17
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0
69
5
12
0
82
0.83
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19
2.2
19
100
0
82
9
4
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58
1.50
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21
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22
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23
0
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1.12
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26
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24
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28
0
3
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1.05
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11
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3
5
28
1.32
12057997--12058040
23
1.9
23
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6
9
52
1.59
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74
2.3
75
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9
204
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11
22
33
1.90
12063330--12063493
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4.6
35
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10
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11
23
33
1.90
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8
3.8
8
100
0
60
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10
26
1.66
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5
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5
100
0
84
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0
0
40
0.97
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3.2
8
100
0
52
61
0
0
38
0.96
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23
2.4
22
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14
56
46
3
0
50
1.19
12071925--12071977
23
2.3
23
77
6
54
50
1
1
45
1.23
12072555--12072593
18
2.2
18
90
0
60
64
5
0
30
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12077346--12077383
18
2.1
18
100
0
76
39
0
28
31
1.57
12077500--12077541
12
3.7
11
76
17
50
38
0
0
61
0.96
12077744--12077778
17
2.1
17
100
0
70
62
11
5
20
1.48
12083730--12083763
17
2.0
17
88
0
50
5
29
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1.71
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31
2.3
30
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11
83
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5
9
38
1.61
12112583--12112654
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2.0
36
100
0
144
27
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5
52
1.63
12112881--12112962
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2.0
41
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0
155
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10
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2
100
0
70
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0
0
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1.00
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32
0
2
64
1.07
12126449--12126513
22
3.0
21
73
8
58
72
3
9
15
1.23

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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