Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  110  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
34050745--34051256
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2
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24
24
25
2.00
34050752--34051256
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1.9
262
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24
25
2.00
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2.8
131
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1.99
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4.6
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1.99
34051602--34051826
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2.6
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2
290
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22
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1.96
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2.0
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220
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14
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1.93
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1.9
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3.7
42
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26
15
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1.96
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14
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1.95
34061030--34061200
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3.6
48
81
9
154
29
25
15
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1.96
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209
29
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1.96
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1.99
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50
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22
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177
36
21
20
22
1.95
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230
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20
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1.96
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0
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18
0
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20
0
40
39
1.53
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14
4.1
14
80
4
64
18
0
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1
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46
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34065163--34065282
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16.9
7
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9
55
20
0
36
41
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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2.2
16
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0
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2.2
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0
0
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2
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13
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0
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12
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22
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22
27
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0
0
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2
0
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2.3
23
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3
0
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0
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0
0
50
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106
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1
0
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3
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4
31
1.33
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2.1
16
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5
50
66
0
0
33
0.92
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2.7
24
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0
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23
17
32
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1.96
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27
4.3
26
84
9
133
37
22
22
17
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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54
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151
37
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22
17
1.94
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26
2.8
26
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85
31
10
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1.89
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2.4
40
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20
27
24
26
1.99
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26
4.2
26
92
2
168
36
25
4
33
1.76
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35
2.3
36
95
2
146
35
14
12
37
1.84
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17
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10
134
35
15
11
37
1.84
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35
2.7
35
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7
126
36
14
12
37
1.84
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19
3.9
18
88
9
74
37
15
11
35
1.84
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40
1.9
40
88
0
116
13
14
36
35
1.85
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40
2.4
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84
7
111
12
12
38
36
1.82
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2.5
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29
1.94
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5
147
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25
12
29
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159
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26
13
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1.98
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2.5
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1.97
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1.9
17
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5
50
44
23
0
32
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
34151363--34151476
31
3.5
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14
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1.90
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38
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234
21
22
17
38
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2.0
69
98
0
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23
21
15
39
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24
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24
21
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27
1.99
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0
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11
36
1.88
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25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
34156997--34157046
18
2.8
18
74
17
50
70
0
16
14
1.18
34158359--34158428
29
2.4
29
90
0
104
25
17
28
28
1.97
34162502--34162604
29
3.6
28
85
5
127
27
27
17
28
1.98
34163248--34163283
2
18.0
2
94
0
63
47
0
2
50
1.15
34170647--34170749
29
3.6
28
85
5
127
27
27
17
28
1.98
34171393--34171422
2
15.0
2
92
0
51
46
0
3
50
1.18
34174265--34174366
29
3.5
29
77
5
91
23
17
29
29
1.97
34179991--34180040
18
2.8
18
74
17
50
70
0
16
14
1.18
34181341--34181414
29
2.6
29
88
0
103
25
17
28
28
1.98
34186402--34186475
29
2.6
29
88
0
112
25
28
16
29
1.97
34195390--34195511
55
2.2
55
85
0
145
13
31
30
24
1.93
34197462--34197679
40
5.5
40
89
4
309
25
28
22
23
1.99
34205416--34205626
40
5.3
40
85
5
268
26
28
20
24
1.99
34210886--34210936
24
2.1
24
92
0
84
33
13
27
25
1.94
34216160--34216347
40
4.7
40
88
1
243
25
28
21
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
34224244--34224428
40
4.6
40
92
1
282
25
29
21
24
1.99
34227899--34227930
14
2.4
13
90
10
55
18
6
12
62
1.50
34233499--34233550
23
2.3
23
83
9
63
21
11
3
63
1.43
34240131--34240161
11
2.8
11
100
0
62
0
9
25
64
1.24
34241246--34241291
22
2.1
22
95
0
83
45
4
30
19
1.70
34244668--34244833
77
2.1
78
87
4
255
22
22
28
26
1.99
34244668--34244833
39
4.3
39
91
3
255
22
22
28
26
1.99
34250791--34250988
39
5.1
39
91
0
315
21
22
29
26
1.99
34253161--34253186
6
4.3
6
100
0
52
84
0
0
15
0.62
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27
2.0
27
96
0
99
22
12
18
46
1.83
34255963--34255991
12
2.3
13
94
5
51
82
0
3
13
0.79
34265645--34265696
27
1.9
27
84
0
68
34
21
23
21
1.97
34266436--34266635
27
7.4
27
81
2
204
28
20
15
36
1.93
34269977--34270004
14
2.0
14
100
0
56
85
0
0
14
0.59
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23
1.9
23
85
0
61
79
2
9
9
1.02
34290420--34290480
27
2.3
27
82
5
70
36
6
1
55
1.36
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12
3.0
12
84
7
56
35
5
0
59
1.20
34290500--34290555
29
1.9
30
85
10
80
30
3
0
66
1.09
34290683--34290797
10
11.7
10
68
23
57
35
4
2
57
1.32
34292981--34293059
19
4.2
19
87
9
117
36
10
17
35
1.84
34292971--34293057
36
2.4
36
75
22
110
36
10
17
35
1.84
34295770--34295812
23
2.0
21
86
9
59
13
16
20
48
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
34299727--34299769
1
43.0
1
80
0
50
90
0
4
4
0.54
34299728--34299769
15
2.8
15
96
0
75
90
0
4
4
0.55
34300681--34300858
45
4.0
43
70
15
121
33
18
21
25
1.96
34300957--34301431
87
5.4
87
64
16
239
32
18
20
28
1.96
34300810--34301391
175
3.3
174
92
0
914
32
19
19
27
1.96
34305988--34306077
30
3.1
30
92
6
141
24
22
12
41
1.88
34306269--34306434
24
7.0
24
91
4
248
26
22
22
28
1.99
34306269--34306434
47
3.5
48
90
5
248
26
22
22
28
1.99
34306484--34306543
20
3.0
20
95
0
111
33
20
10
36
1.86
34306484--34306538
11
5.4
11
70
16
55
30
20
10
38
1.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335