Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  71  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2
0
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1.02
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2.7
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12
29
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
26
100
0
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19
19
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0
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24
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2
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0
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40
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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2
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2
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1.13
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2.0
81
87
0
236
27
16
18
37
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24479066--24479107
20
2.2
20
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19
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95
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5
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1.49
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0
67
55
13
4
26
1.58
24492579--24492655
18
4.3
18
79
0
64
54
14
6
24
1.63
24492579--24492656
12
6.5
12
80
0
57
55
14
6
24
1.62
24492666--24492713
12
4.0
12
83
0
60
58
12
8
20
1.60
24492666--24492713
18
2.7
18
86
0
69
58
12
8
20
1.60
24493688--24493730
23
1.9
22
85
4
59
65
2
4
27
1.25
24496144--24496172
2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
24500787--24500821
3
11.7
3
93
0
61
37
0
34
28
1.58
24501969--24502037
30
2.3
30
89
0
102
55
10
4
30
1.53
24503079--24503119
16
2.7
16
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7
50
51
2
0
46
1.14
24504764--24504815
27
1.9
27
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0
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28
28
17
25
1.97
24504765--24504824
27
2.2
27
81
0
66
30
26
18
25
1.98
24506065--24506469
111
3.7
108
81
8
439
49
6
9
34
1.61
24507168--24507226
29
2.0
30
90
3
93
49
11
5
33
1.62
24508727--24508800
30
2.5
29
79
14
80
54
6
1
37
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24512835--24512861
12
2.2
12
100
0
54
33
0
14
51
1.43
24515050--24515076
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
24516160--24516342
64
2.8
64
78
10
203
22
29
17
30
1.97
24517076--24517136
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
24525632--24525679
24
2.1
24
84
7
64
12
20
6
60
1.54
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6
4.8
6
100
0
58
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0
17
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1.45
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6
5.2
6
100
0
62
19
0
16
64
1.29
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76
2.0
76
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0
286
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9
24
32
1.87
24541293--24541385
30
3.1
30
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0
141
59
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2
26
1.44
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12
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3
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30
0
0
69
0.89
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23
2.3
23
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33
0
1
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1.05
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21
2.3
21
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0
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50
16
16
16
1.79
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21
5.2
20
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17
52
27
7
1
62
1.34
24556838--24556971
20
6.8
19
68
11
58
27
7
2
62
1.34
24556878--24556980
27
3.6
29
71
7
75
28
6
1
63
1.31
24556929--24556981
19
2.7
19
78
18
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24
5
1
67
1.22
24556963--24557020
27
2.1
28
84
9
84
37
3
0
58
1.15
24556969--24557022
27
2.0
26
92
3
90
38
3
0
57
1.17
24558661--24558693
17
1.9
17
93
0
57
33
21
12
33
1.90
24561651--24561693
6
7.5
6
89
10
72
0
16
46
37
1.47
24561651--24561693
16
2.5
18
88
11
72
0
16
46
37
1.47
24562071--24562115
13
3.3
14
84
12
58
60
0
6
33
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24568913--24568985
37
2.0
37
97
0
137
20
19
6
53
1.67
24569283--24569329
7
6.4
7
80
9
58
70
2
0
27
0.99
24569283--24569329
15
3.2
14
82
8
58
70
2
0
27
0.99
24569289--24569345
22
2.6
20
79
17
60
64
1
1
31
1.13
24569384--24569445
28
2.1
29
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5
81
58
6
3
32
1.40
24570881--24570928
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31
0
0
68
0.90
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2
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0
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0
0
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0
0
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3.6
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7
151
26
23
29
20
1.99
24574928--24575077
79
1.9
80
83
4
196
26
22
28
22
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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