Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  3  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
644179--644220
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16
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0
0
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0
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2.6
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1
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2
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100
0
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2.1
13
100
0
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2.0
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2.8
24
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27
20
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0
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704244--704451
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18
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143
48
12
0
37
1.49
704240--704451
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8.0
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161
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0
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10
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1.9
105
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286
48
12
0
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1.48
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105
2.4
102
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235
47
13
1
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1.50
710095--710145
21
2.4
21
80
0
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29
19
49
1
1.60
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2.2
31
83
0
80
17
4
17
59
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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14
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11
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2
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1.37
711824--711892
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2.3
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10
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6
7.7
6
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9
60
37
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0
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717538--717580
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16
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0
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0
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24
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2.1
23
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0
4
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19
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11
56
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0
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10.0
3
100
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21
1.40
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13
86
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5
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1.47
757552--757610
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19
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7
73
32
0
0
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0
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0
0
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100
0
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0
0
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2.9
17
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14
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42
6
0
51
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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0
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22
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0
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2
11
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22
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59
55
0
2
41
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2
1
38
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0
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10
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1
1
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2.4
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0
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24
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27
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1.97
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0
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100
0
52
61
0
26
11
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
868867--868891
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0
0
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2.2
20
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2
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59
1.30
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2
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0
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0
0
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1.00
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0
0
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0
0
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10
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13
17
11
57
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30
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14
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12
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0
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0
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1.9
117
100
0
436
24
30
25
19
1.98
901523--901553
16
1.9
16
93
0
53
41
0
3
54
1.16
901633--901663
12
2.6
12
94
0
53
74
0
25
0
0.82
910961--911079
48
2.5
48
98
1
231
38
18
0
42
1.50
914274--914324
24
2.2
23
82
10
59
70
0
1
27
0.98
914291--914337
24
1.9
25
87
12
71
72
4
0
23
1.02
928520--928566
17
2.9
16
84
9
51
8
0
14
76
1.01
928530--928566
16
2.2
18
86
13
53
8
0
10
81
0.89
934518--934551
18
1.9
17
88
5
50
47
0
2
50
1.16
934595--934639
12
3.6
12
84
6
54
57
2
2
37
1.23
935198--935237
11
3.7
11
86
6
64
25
45
0
30
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
935729--935782
12
4.5
12
88
9
83
42
0
1
55
1.10
937099--937137
18
2.1
19
85
4
53
41
2
10
46
1.51
938751--938879
44
2.8
45
82
4
152
34
13
24
27
1.93
941361--941434
18
4.1
18
84
6
105
31
22
12
33
1.91
945405--945447
11
4.0
11
80
17
54
20
48
4
25
1.69
945404--945445
21
2.0
21
90
4
66
21
50
2
26
1.61
946782--946857
28
2.7
28
93
2
125
28
6
19
44
1.76
947053--947096
21
2.2
20
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8
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52
6
0
40
1.28
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1.9
13
100
0
50
32
0
0
68
0.90
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21
1.9
21
89
0
62
15
30
25
30
1.95
958179--958225
18
2.6
18
76
13
51
53
4
0
42
1.20
958994--959028
15
2.3
15
95
0
61
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0
14
2
0.77
986796--986871
13
5.9
13
78
9
59
35
7
22
34
1.83
999569--999653
42
2.0
42
97
0
161
45
14
14
25
1.82
1002135--1002282
72
2.1
72
93
0
251
29
28
12
29
1.93
1004657--1004688
16
2.0
16
100
0
64
12
6
6
75
1.19
1004733--1004761
12
2.5
12
94
5
51
27
6
6
58
1.50
1009359--1009487
50
2.5
51
90
5
199
35
16
22
25
1.94
1009463--1009580
31
3.8
31
87
0
164
27
19
27
25
1.99
1009652--1009743
42
2.2
41
86
7
123
31
13
27
28
1.93
1009832--1009960
50
2.5
51
90
5
199
35
16
22
25
1.94
1009936--1010053
31
3.8
31
91
0
182
27
19
27
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1009265--1010216
473
2.0
473
98
0
1850
33
14
25
26
1.95
1010125--1010239
42
2.7
43
86
4
153
31
14
26
27
1.95
1018579--1018626
24
2.0
23
84
11
62
50
0
6
43
1.27
1021381--1021508
3
43.0
3
70
17
63
32
2
4
60
1.30
1021371--1021421
23
2.1
26
85
10
72
23
3
5
66
1.30
1021381--1021508
12
10.2
13
70
23
73
32
2
4
60
1.30
1021609--1021650
3
14.0
3
89
0
66
33
4
0
61
1.17
1021812--1021836
12
2.1
12
100
0
50
32
16
0
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1.44
1027680--1027718
19
2.0
20
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5
62
56
0
30
12
1.37
1030736--1030774
7
5.9
7
88
5
55
25
10
64
0
1.25

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335