Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  74  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24949619--24949657
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1.9
21
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0
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1.00
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1.99
24951876--24952003
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3.3
39
87
5
170
26
21
25
26
1.99
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0
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26
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24960160--24960190
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18
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0
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0
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17
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39
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0
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1.68
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50
6
13
1.66
25003476--25004220
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5.0
146
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903
28
50
7
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1.68
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1.8
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2.2
126
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3
327
54
5
9
31
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0
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2.0
22
90
9
70
26
0
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69
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
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85
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22
1.98
25007050--25007233
43
4.3
43
84
5
221
32
25
19
22
1.98
25007050--25007281
43
5.4
44
81
9
187
32
26
18
21
1.97
25011406--25011449
18
2.4
18
85
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54
36
0
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22
1.54
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26
10
10
52
1.69
25011579--25011876
147
2.0
149
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1
528
26
10
10
52
1.69
25012230--25012381
21
6.9
21
72
14
117
44
26
1
26
1.65
25012214--25012304
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2.0
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41
26
2
29
1.67
25012230--25012381
67
2.3
67
90
2
234
44
26
1
26
1.65
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3.1
41
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0
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23
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16
25
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2.4
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0
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26
26
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29
2.4
29
78
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79
25
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1.99
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2.2
16
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5
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2.3
27
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88
23
8
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1.80
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2.2
19
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4
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52
5
0
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1.23
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19
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1.95
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2.1
90
100
0
378
33
21
20
24
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44
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102
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18
21
1.94
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18
3.4
18
67
18
59
43
17
5
33
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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44
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19
22
1.96
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0
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0
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1.9
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0
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59
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11
22
1.56
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22
2.2
22
85
7
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42
2
2
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1.24
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2.0
21
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59
2
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1.37
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2
69
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0
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9
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58
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19
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1.97
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26
20
21
1.98
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20
21
1.98
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20
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1.98
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2.3
206
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19
22
28
1.98
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130
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69
1.13
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0
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15
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1.15
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10
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1.77
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20
2.1
20
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4
59
60
0
0
39
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25136274--25136303
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1.9
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51
56
6
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1.26
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25
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0
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1.47
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0
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50
0
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0
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33
0
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64
1.07
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21
3.3
19
79
12
60
33
0
7
58
1.27
25152319--25152383
19
3.3
19
77
12
60
33
0
7
58
1.27
25154660--25154685
7
3.7
7
100
0
52
61
11
0
26
1.30
25156848--25156919
33
2.2
33
85
5
92
43
30
4
22
1.72
25158309--25158344
2
18.0
2
100
0
72
50
0
0
50
1.00
25161857--25161890
3
11.3
3
100
0
68
32
0
0
67
0.91
25163831--25163869
16
2.4
16
95
0
69
38
10
5
46
1.60
25163940--25163991
22
2.3
23
77
9
63
73
1
0
25
0.94
25163985--25164056
29
2.4
31
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9
87
38
20
1
38
1.62
25164291--25164315
13
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13
100
0
50
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12
0
8
0.92
25164520--25164562
20
2.1
21
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4
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4
11
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76
1.13
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46
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21
20
27
29
1.98
25169042--25169212
93
1.8
93
93
0
297
21
21
28
28
1.98
25169442--25169479
19
2.0
20
85
15
53
36
0
23
39
1.55
25176611--25176783
46
3.7
46
79
10
208
21
20
27
29
1.98
25176608--25176778
93
1.8
93
93
0
297
21
21
28
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25177006--25177043
19
2.0
20
85
15
53
36
0
23
39
1.55
25181910--25181954
23
2.0
23
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0
81
35
35
11
17
1.86
25183959--25184130
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
25183951--25184126
46
3.8
46
80
12
225
28
28
21
21
1.98
25186509--25186597
30
3.0
30
79
11
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56
15
17
10
1.67
25186509--25186591
15
5.6
14
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10
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55
16
18
9
1.68
25186520--25186597
15
5.2
15
75
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55
15
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11
1.69
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1.8
93
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0
317
27
29
21
20
1.98
25189537--25189712
46
3.8
46
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12
225
28
28
21
21
1.98
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1.9
44
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0
105
34
19
21
25
1.96
25191661--25192060
44
9.1
44
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8
197
29
22
19
29
1.98
25191652--25192097
175
2.5
176
88
1
655
28
21
20
28
1.98
25191652--25192158
88
5.8
88
86
2
605
29
22
20
28
1.98
25191661--25192158
263
1.9
264
84
3
673
29
22
19
28
1.98
25192165--25192401
44
5.3
43
74
8
199
28
18
23
28
1.98
25192162--25192401
133
1.8
133
86
1
347
29
19
23
28
1.98
25194190--25194220
16
1.9
16
93
0
53
35
22
0
41
1.54
25194187--25194226
20
2.0
20
85
0
53
37
22
0
40
1.54
25194299--25194343
23
1.9
24
90
4
74
20
24
11
44
1.83
25194470--25194666
55
3.6
53
78
6
182
22
24
16
36
1.94
25197756--25197842
26
3.3
27
84
9
92
31
3
1
64
1.17
25199164--25199223
25
2.4
25
80
8
68
61
8
11
18
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25202698--25202872
3
57.7
3
67
17
51
26
5
5
62
1.39
25203047--25203101
3
18.3
3
92
0
92
32
1
1
63
1.15
25218825--25219145
46
7.0
46
90
2
439
38
15
23
21
1.92
25221471--25221511
22
1.9
21
85
5
55
29
2
0
68
1.03
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18
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35
7
0
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1.26
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2.0
26
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0
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0
0
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1.00
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2.5
25
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37
0
1
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62
1
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1.22
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2.9
15
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62
0
2
34
1.08
25231617--25231647
15
2.1
15
93
0
53
41
0
0
58
0.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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