Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  301  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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0
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Period
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Number
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Percent
Indels
Score
A
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Indices
Period
Size
Copy
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Indels
Score
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11
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17
17
34
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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63
19.8
60
67
11
344
28
34
16
21
1.95
89729550--89729576
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
89730733--89730784
25
2.1
25
96
0
95
19
25
11
44
1.84
89732128--89732160
16
2.2
15
89
10
50
66
0
0
33
0.92
89732817--89732863
21
2.2
22
88
3
69
6
12
17
63
1.48
89733635--89733716
40
2.0
40
100
0
164
26
18
13
41
1.87
89736253--89736305
23
2.3
23
87
6
72
47
1
0
50
1.12
89736261--89736293
17
2.0
16
94
5
57
45
0
0
54
0.99
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12
2.8
14
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19
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50
7
0
42
1.31
89750536--89750730
72
2.7
71
84
4
239
25
14
23
36
1.93
89750761--89751088
88
3.7
88
88
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471
25
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22
34
1.96
89750983--89751017
14
2.5
14
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0
52
17
20
5
57
1.60
89750998--89751325
74
4.1
75
71
15
257
28
19
21
30
1.98
89750930--89752110
165
7.2
163
81
9
1170
28
18
19
33
1.96
89751257--89751428
93
1.8
93
82
2
220
25
22
21
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89751329--89752321
77
12.2
79
69
19
432
28
17
18
35
1.94
89751485--89751519
14
2.5
14
90
0
52
17
20
5
57
1.60
89751408--89751675
91
3.0
90
84
7
379
28
19
15
36
1.92
89751499--89751943
147
2.9
153
81
8
519
30
17
17
34
1.93
89751499--89752321
88
10.2
77
72
15
462
28
17
17
36
1.93
89751962--89751997
14
2.7
13
86
4
54
30
13
5
50
1.65
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30
2.0
30
90
6
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20
10
28
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1.84
89751731--89752321
254
2.4
247
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5
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16
18
37
1.92
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2.7
27
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1.11
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2
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0
77
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2
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48
1.14
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44
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1
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30
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1.95
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4.2
21
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2
4
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1.28
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25
3.0
24
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15
71
35
1
2
60
1.19
89761490--89761550
18
3.2
18
74
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37
1
1
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1.17
89761490--89761601
37
3.0
38
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1.25
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1.20
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3
2
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1.26
89768737--89768772
10
3.6
10
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0
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8
0
30
1.26
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112
2.0
112
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0
418
47
3
16
32
1.63
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18
1.9
19
94
5
65
44
0
0
55
0.99
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159.0
3
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14
152
30
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1.44
89784869--89784984
39
3.0
39
96
0
205
37
21
27
13
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89784869--89785003
39
3.4
38
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4
191
36
22
26
14
1.93
89787181--89787248
32
2.1
33
81
13
79
66
16
11
5
1.42
89787185--89787244
21
2.8
23
75
12
65
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13
13
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1.43
89788366--89788461
10
10.0
10
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4
0
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1.15
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7
118
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5
0
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89788412--89788455
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0
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0
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0
0
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2
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0
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0
50
0
50
1.00
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2
24.5
2
95
0
89
46
0
2
51
1.12

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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