Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  324  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
23
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2
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1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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25
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35
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182
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11
15
36
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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0
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0.66
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9
81
15
68
82
0
17
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22.0
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100
0
132
0
33
0
66
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95279322--95279346
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1.9
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2.6
15
83
0
51
66
0
5
28
1.12
95286952--95286999
21
2.2
22
85
3
62
72
2
2
22
1.05
95287073--95287111
3
13.0
3
88
0
60
64
2
0
33
1.08
95287088--95287361
130
2.1
132
83
6
344
59
6
4
29
1.42
95287218--95287555
113
2.9
112
88
6
455
59
7
4
28
1.43
95287236--95287593
113
3.1
115
86
6
440
59
8
4
28
1.45
95289230--95289263
16
2.1
17
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5
52
38
0
0
61
0.96
95289225--95289287
27
2.4
26
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12
76
36
0
0
63
0.95
95291984--95292035
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1.9
27
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0
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48
3
7
40
1.50
95300224--95300257
3
11.3
3
100
0
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0
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0
0.91
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11
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27
0
2
69
1.02
95314349--95314478
39
3.3
39
78
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138
31
15
16
36
1.90
95315607--95315664
23
2.7
22
84
10
75
32
17
8
41
1.80
95316182--95316209
14
2.0
14
100
0
56
28
21
7
42
1.79
95322643--95322692
22
2.3
22
96
0
91
38
52
0
10
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95322670--95322731
13
5.1
13
75
15
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40
50
0
9
1.35
95322652--95322731
35
2.3
35
88
0
124
38
51
0
10
1.36
95322683--95322727
22
2.0
22
91
0
72
40
51
0
8
1.33
95323126--95323170
3
14.7
3
86
4
63
28
2
2
66
1.15
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9
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7
50
35
11
0
53
1.38
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39
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11
1
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1.44
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2.1
68
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0
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1.40
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1.29
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2
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0
4
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1.22
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100
0
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0
0
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0
0
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50
1.00
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2.0
316
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2
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34
1.89
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2.0
50
100
0
202
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1.88
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7.0
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22
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158
26
20
29
23
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46
4.8
45
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214
21
30
21
26
1.99
95346768--95346990
92
2.4
91
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7
263
22
30
21
26
1.99
95348401--95348502
50
2.1
49
92
1
168
39
21
8
30
1.84
95350295--95350332
19
2.0
19
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10
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36
28
0
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1.58
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456
2.0
456
99
0
1825
38
14
9
37
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95354099--95354158
31
1.9
31
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0
75
45
15
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1.83
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28
2.1
28
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56
3
1
37
1.26
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3.1
13
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58
0
0
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0
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0
0
28
0.86
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2.1
30
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0
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2.3
22
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0
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2.1
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0
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0
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11
1.25
95393370--95393421
14
3.7
14
76
19
54
65
1
26
5
1.26

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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