Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  58  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Period
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Number
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Indels
Score
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23
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1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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(0-2)
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20614748--20614799
15
3.2
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1.11
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0
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46
88
1
194
31
26
21
20
1.98
20639043--20639076
16
2.2
15
89
5
50
35
0
0
64
0.94
20644823--20644974
44
3.3
44
75
17
125
44
4
3
48
1.40
20649826--20649850
4
6.2
4
100
0
50
52
24
0
24
1.48
20654469--20654494
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
20659600--20659672
36
2.0
36
100
0
146
42
13
16
27
1.86
20666674--20666840
35
4.6
36
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8
196
33
25
10
30
1.90
20666669--20666840
75
2.4
73
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8
217
33
24
11
30
1.90
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2
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2
100
0
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0
0
50
1.00
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13
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0
56
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32
1.83
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5
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0
12
0
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0.54
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19
1.9
19
88
11
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0
14
0
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0.59
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29
2.1
29
85
8
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39
4
4
50
1.45
20683421--20683452
15
2.0
17
88
11
50
75
3
6
15
1.14
20683457--20683503
24
1.9
24
86
4
67
61
0
0
38
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20684989--20685026
15
2.5
15
100
0
76
13
28
10
47
1.76
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29
2.1
27
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12
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41
0
0
58
0.98
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19
2.1
19
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0
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48
15
7
28
1.72
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7
5.3
7
96
3
56
45
0
8
45
1.34
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16
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9
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2
5
2
88
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28
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0
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14
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51
0
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44
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28
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18
26
1.98
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2.1
23
100
0
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2.2
19
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0
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1.53
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6
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30
0
0
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2.0
23
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8
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28
0
0
71
0.87
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1
0
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1.00
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2.0
45
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26
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68
1.14
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5
5.4
5
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0
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0
0
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0.76
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31
2.0
31
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32
1.21
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37
2.0
37
100
0
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21
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21
50
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20721828--20721857
15
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70
0
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32
2.5
37
72
20
94
54
2
1
42
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20730770--20730822
15
3.2
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58
0
0
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13
2.8
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10
28
42
1.83
20739316--20739409
24
3.8
24
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54
0
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2.0
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0
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118
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21
1.9
21
85
10
55
72
2
0
25
0.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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