Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  35  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Percent
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Score
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1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
A
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(0-2)
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4
6
15
73
1.19
13143626--13143687
30
2.1
30
90
6
99
41
29
9
19
1.83
13145118--13145293
46
3.8
46
79
5
203
21
20
28
28
1.98
13145115--13145286
93
1.8
93
93
2
301
22
20
29
27
1.99
13146622--13147142
75
6.5
79
73
14
271
32
19
17
31
1.94
13146738--13146913
97
1.8
97
83
2
237
32
18
18
30
1.95
13146835--13147142
75
4.0
75
83
8
386
32
20
16
30
1.95
13146615--13147087
248
1.9
249
84
4
632
32
17
17
31
1.94
13147111--13147216
54
1.9
54
83
9
135
38
19
14
27
1.90
13146990--13147399
223
1.9
210
84
8
536
37
20
15
26
1.93
13147207--13147371
71
2.3
71
87
6
244
41
21
15
22
1.90
13147371--13147634
70
3.7
71
84
4
356
37
22
14
25
1.92
13147371--13147634
71
3.7
69
84
4
339
37
22
14
25
1.92
13147210--13147801
257
2.3
256
94
2
1013
36
22
14
26
1.93
13149824--13150003
47
3.8
49
79
15
200
28
29
20
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13149832--13150003
94
1.8
93
93
1
299
28
29
20
20
1.98
13153375--13153535
46
3.6
44
85
8
184
24
31
20
23
1.98
13153418--13153580
46
3.6
43
82
6
166
22
32
19
25
1.97
13156031--13156210
47
3.8
49
79
15
200
28
29
20
21
1.98
13156039--13156210
94
1.8
93
93
1
299
28
29
20
20
1.98
13158126--13158158
7
4.7
7
89
10
50
0
12
0
87
0.53
13165702--13165790
19
4.3
19
67
26
56
57
5
4
32
1.42
13166548--13166643
31
3.1
32
85
7
126
6
4
14
75
1.16
13166579--13166643
30
2.3
26
82
17
76
4
6
15
73
1.19
13166721--13166761
17
2.3
18
84
12
50
14
0
41
43
1.45
13167794--13167835
20
2.1
20
100
0
84
19
4
0
76
0.96
13169921--13169954
2
17.5
2
87
6
52
44
0
2
52
1.16
13170918--13170952
10
3.6
10
84
7
54
68
2
0
28
1.04
13170946--13170997
25
2.0
28
88
11
83
51
3
1
42
1.31
13171007--13171071
20
3.3
19
74
20
62
55
6
6
32
1.49
13171542--13171597
20
2.9
20
84
5
71
32
3
1
62
1.23
13180939--13181054
58
2.0
58
98
0
223
24
19
24
31
1.98
13184493--13184775
18
15.3
18
70
12
144
35
14
13
36
1.86
13184493--13184775
36
7.6
36
69
12
169
35
14
13
36
1.86
13184574--13184775
72
2.8
72
79
8
198
36
15
13
35
1.86
13191035--13191195
46
3.6
44
85
8
184
24
31
20
23
1.98
13191078--13191240
46
3.6
43
82
6
166
22
32
19
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13195533--13195583
25
2.0
26
85
7
70
25
11
23
39
1.89
13197588--13197765
47
3.8
49
78
16
182
29
29
19
21
1.98
13197596--13197765
94
1.8
91
92
3
286
28
30
20
21
1.98
13200410--13200613
46
4.5
45
82
11
206
23
30
20
25
1.98
13200453--13200669
92
2.4
91
83
4
258
22
31
19
26
1.98
13200453--13200661
46
4.6
44
79
11
181
22
31
19
27
1.98
13203116--13203295
47
3.8
49
79
15
200
28
29
20
21
1.98
13203124--13203295
94
1.8
93
93
1
299
28
29
20
20
1.98
13205799--13205882
26
3.2
26
94
0
141
35
22
5
35
1.79
13212579--13212638
33
1.9
32
87
12
90
58
8
3
30
1.44

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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