Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  7  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2331079--2331107
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14
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0
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20
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2.0
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100
0
110
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2.0
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20
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5.4
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44
2.8
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152
34
13
24
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1.9
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13
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28
2.8
28
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26
26
19
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0
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2.0
22
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28
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1
0
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3.2
9
90
9
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0
13
43
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2443111--2443150
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2.1
19
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0
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33
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14
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1.42
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6
4.7
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100
0
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17
35
17
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2.0
38
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0
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25
2.4
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16
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1
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1.28
2459279--2459339
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1
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2.0
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20
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2
0
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2.3
25
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42
1
0
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1.09
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159
2.0
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11
4
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3.0
15
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63
63
0
4
31
1.14
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4.6
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31
10
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75
2.4
75
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31
11
23
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4.6
35
82
8
172
31
10
24
33
1.90
2501042--2501212
75
2.4
75
85
7
221
31
11
23
33
1.90
2511572--2511837
46
6.0
45
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8
339
21
23
15
39
1.92
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38
2.0
38
100
0
152
21
26
18
34
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
0
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2
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2
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6
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0
0
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21
29
27
1.98
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39
4.9
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5
179
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21
29
28
1.99
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15
115
15
19
23
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71
22
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1
1
50
1.17
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4.4
20
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1
1
48
1.16
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14
22
19
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1.94
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2.2
151
93
1
557
35
15
22
26
1.94
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22
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24
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0
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0
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18
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0
83
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0
2
76
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2575317--2575355
13
3.0
13
88
7
53
20
0
2
76
0.90
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0
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20
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0
0
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0
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0
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2646281--2646452
75
2.4
73
84
8
226
33
23
11
31
1.90
2650666--2650838
46
3.8
46
79
14
214
28
29
21
20
1.98
2650674--2650843
91
1.8
92
94
2
306
27
30
21
20
1.98
2653222--2653310
30
3.0
30
80
8
101
57
15
16
10
1.65
2653222--2653301
15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
2653233--2653310
15
5.2
15
78
9
79
56
15
16
11
1.67
2656260--2656431
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
2656252--2656427
46
3.8
46
80
12
225
28
28
21
21
1.98
2662153--2662319
35
4.6
35
85
7
201
33
24
10
31
1.90
2662148--2662319
75
2.4
73
84
8
226
33
23
11
31
1.90
2668133--2668177
21
2.1
21
87
0
63
15
22
22
40
1.91
2682311--2682536
113
2.0
113
98
0
434
30
14
9
46
1.76
2689218--2689284
27
2.4
28
78
9
66
31
17
0
50
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2689249--2689278
13
2.4
13
94
5
53
30
16
0
53
1.44
2690212--2690256
3
15.0
3
100
0
90
66
0
0
33
0.92
2690395--2690465
3
25.0
3
72
16
62
59
1
0
39
1.06
2691329--2691464
51
2.7
51
77
0
155
39
6
12
41
1.69
2693147--2693436
96
3.0
96
92
0
463
36
18
33
11
1.87
2694343--2694478
51
2.7
51
77
0
155
39
6
12
41
1.69
2695133--2695186
27
2.0
27
100
0
108
25
11
22
40
1.87
2701478--2701527
20
2.5
20
83
6
66
54
0
0
46
1.00
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38
2.1
38
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0
120
29
3
5
61
1.35
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29
2.4
28
80
11
84
38
2
1
57
1.23
2702652--2702678
12
2.2
12
100
0
54
59
0
0
40
0.98
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193
2.0
193
88
1
567
44
8
7
39
1.64
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19
2.0
19
89
0
58
23
0
13
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1.30
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22
2.1
22
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11
60
26
0
13
60
1.32
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17
2.2
18
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60
2
0
36
1.11
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2
15.5
2
100
0
62
48
0
0
51
1.00
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23
1.9
23
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0
70
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4
2
31
1.28
2720699--2720741
11
3.8
11
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17
52
65
2
2
30
1.18
2724228--2724262
2
17.5
2
100
0
70
48
0
0
51
1.00
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26
2.2
26
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16
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43
1
1
53
1.20
2735956--2736037
17
4.6
17
72
15
60
60
0
2
36
1.10
2736106--2736140
17
2.0
18
94
5
63
34
14
0
51
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2739757--2739781
5
5.0
5
100
0
50
0
60
0
40
0.97
2739809--2739836
5
5.6
5
100
0
56
57
42
0
0
0.99
2745224--2745264
16
2.7
15
85
7
55
63
0
2
34
1.08
2745267--2745310
17
2.6
16
85
7
52
36
2
4
56
1.32
2750539--2750579
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
2753429--2753482
15
3.5
15
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12
56
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3
16
5
1.16
2755287--2755471
18
10.3
18
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9
162
35
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18
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0
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36
12
14
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2757396--2757442
21
2.2
21
85
7
60
57
0
0
42
0.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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