Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  291  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87392792--87392967
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28
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3.0
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3.0
32
92
0
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6
31
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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100
0
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1.65
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3.0
32
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1.80
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57
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60
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2.0
25
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0
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19
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16
30
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1.9
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26
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13
22
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1.93
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28
15
20
34
1.94
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46
5.3
46
78
6
157
30
14
21
33
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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18
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5
0
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1.15
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2
5
80
1.00
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14
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0
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51
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17
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1
26
1.13
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10
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10
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2
2
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1.05
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19
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0
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1.07
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81
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3
1
22
1.12
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1
1
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1.99
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18
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1.95
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1.94
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1.95
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51
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0
0
56
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87536251--87536296
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13
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1.71
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28
12
17
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18
20
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1.96
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0
0
48
1.00
87561372--87561413
17
2.6
16
82
14
50
23
26
4
45
1.73
87563122--87563160
18
2.2
17
86
4
51
20
33
20
25
1.97
87565536--87565606
35
2.0
35
88
0
106
26
22
19
30
1.98
87570169--87570351
40
4.5
40
77
8
181
38
18
19
24
1.93
87570450--87570544
38
2.4
38
80
3
109
49
29
1
20
1.56
87570654--87570722
7
9.7
7
79
3
57
23
1
27
47
1.60
87570675--87570726
15
3.5
15
81
2
61
21
1
28
48
1.61
87571038--87571197
7
21.9
7
71
13
54
23
1
38
37
1.63
87571058--87571147
38
2.4
38
77
7
94
24
0
37
37
1.56
87571383--87571447
26
2.4
28
68
17
64
52
1
0
46
1.10
87576547--87576629
43
1.9
44
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2
114
26
15
30
27
1.96
87577485--87577512
14
2.0
14
100
0
56
35
21
14
28
1.92
87583249--87583398
75
2.0
75
90
1
239
28
12
18
41
1.86
87587355--87587401
25
1.9
25
86
4
69
46
0
2
51
1.13
87587418--87587484
20
3.3
20
72
4
62
56
1
5
35
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87587457--87587519
19
3.3
19
77
2
63
69
1
6
22
1.19
87598156--87598265
26
4.2
26
90
0
175
33
6
24
35
1.81
87598156--87598265
52
2.1
52
98
0
211
33
6
24
35
1.81
87602402--87602686
126
2.3
127
83
3
360
28
15
18
37
1.91
87602414--87602735
126
2.5
126
81
3
317
27
15
18
39
1.90
87608517--87608594
16
4.5
17
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23
65
33
3
2
60
1.28
87608498--87608595
36
2.8
34
80
9
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35
5
2
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1.33
87608602--87608649
16
2.9
15
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35
2
0
62
1.07
87608661--87608709
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2.1
23
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28
10
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1.50
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18
2.5
19
79
13
51
19
2
6
71
1.18
87610873--87610920
23
2.0
24
92
4
80
52
2
4
41
1.32
87611197--87611257
7
8.6
7
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3
50
26
1
22
49
1.59
87611246--87611316
21
3.4
22
77
11
60
16
0
42
40
1.49
87611240--87611320
28
2.9
28
75
17
78
18
1
38
41
1.58
87611265--87611323
21
2.8
21
76
7
66
16
0
42
40
1.49
87611671--87611734
22
2.9
23
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3
3
29
1.24
87611726--87611847
39
3.1
39
90
1
172
44
18
18
18
1.87
87614935--87615001
33
2.0
33
94
0
116
16
25
13
44
1.84
87615026--87615460
241
1.8
241
97
0
834
34
18
14
33
1.91
87615580--87615707
9
13.6
9
76
9
121
46
21
0
31
1.57
87615597--87615674
39
2.0
39
97
0
147
46
21
0
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1.52
87615593--87615705
57
2.0
57
89
0
172
46
23
0
30
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87621738--87621874
72
1.9
72
89
3
213
21
31
21
25
1.98
87621810--87621965
43
3.6
43
90
0
249
22
30
18
28
1.97
87623985--87624027
11
4.0
11
84
3
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30
2
46
20
1.63
87623985--87624027
21
2.0
21
90
4
68
30
2
46
20
1.63
87628070--87628144
18
4.2
17
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3
78
41
13
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1.86
87628676--87628718
11
4.0
11
84
3
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30
2
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20
1.63
87628676--87628718
21
2.0
21
90
4
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30
2
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20
1.63
87629172--87629214
11
4.0
11
84
6
61
20
46
4
27
1.71
87629171--87629213
21
2.0
21
90
4
68
20
46
2
30
1.63
87634748--87634790
20
2.1
21
95
4
79
58
9
0
32
1.30

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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