Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  57  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20139411--20139473
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23
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1.25
20139411--20139500
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0
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1.60
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23
2
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1.64
20141049--20141330
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0
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1
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1.34
20161164--20161254
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0
4
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3
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1.28
20161476--20161550
10
7.5
10
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1.28
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20
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19
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1
2
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1.20
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0
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0
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15
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1
0
35
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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5
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62
3
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20177266--20177327
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2.7
23
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0
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1.20
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13
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20219718--20219763
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40
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1.51
20221068--20221172
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2.0
52
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201
8
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40
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2.2
19
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2.6
31
85
0
115
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26
21
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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0
0
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1.13
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2.2
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38
20
8
32
1.84
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0
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0
72
0.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20293625--20293747
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79
15
209
29
28
20
21
1.98
20330261--20330433
94
1.8
93
91
3
285
28
28
20
21
1.98
20331677--20331707
6
5.2
6
100
0
62
51
16
16
16
1.77
20331695--20331807
47
2.4
47
92
1
181
39
22
21
16
1.92
20331791--20331886
51
1.9
50
82
6
122
40
22
19
16
1.91
20332272--20332299
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
20332905--20332944
19
2.3
17
87
12
55
0
25
0
75
0.81
20333013--20333045
2
17.0
2
93
6
59
51
0
0
48
1.00
20341411--20341464
30
1.9
26
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14
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29
0
1
68
1.00
20344909--20346406
499
3.0
499
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0
2951
29
21
20
28
1.98
20353716--20353860
74
2.0
74
100
0
290
33
15
18
31
1.93
20355094--20355147
2
27.0
2
96
0
99
48
1
0
50
1.11
20356976--20357010
18
1.9
18
88
0
52
28
0
0
71
0.86
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3
13.3
3
100
0
80
67
0
0
32
0.91
20363683--20363833
53
2.8
53
88
4
205
26
16
27
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20371126--20371276
53
2.8
53
89
4
214
25
16
27
29
1.97
20373217--20373241
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
20374088--20374134
19
2.9
16
80
20
53
63
0
0
36
0.94
20374095--20374132
9
4.2
9
87
9
51
68
0
0
31
0.90
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14
2.2
16
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10
52
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0
0
33
0.92
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15
2.2
15
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0
57
18
12
12
57
1.64
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19
2.1
19
85
4
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41
0
2
56
1.13
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11
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11
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0
2
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1.08
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46
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1
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14
22
21
1.89
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4.1
7
100
0
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13
27
13
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1.82
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31
5.5
31
90
0
252
25
25
18
29
1.98
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50
3.5
50
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2
257
26
21
16
35
1.94
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11
3.9
11
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11
54
35
0
2
62
1.08
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21
3.2
21
66
27
58
40
11
23
25
1.87
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7.8
46
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1
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42
13
23
20
1.87
20403319--20403451
44
3.0
45
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144
35
13
24
27
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39
3.4
39
73
11
107
28
26
20
24
1.99
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5
7.0
5
87
12
54
62
0
0
37
0.95
20410282--20410316
14
2.4
14
90
9
52
62
0
0
37
0.95
20415815--20415893
3
26.3
3
73
19
60
64
1
3
30
1.19
20416193--20416242
25
2.0
25
88
4
73
52
26
2
20
1.57
20416221--20416269
21
2.3
21
96
0
89
63
28
0
8
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20416446--20416472
4
6.8
4
100
0
54
22
0
0
77
0.76
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44
10.6
44
74
8
374
25
22
19
32
1.98
20416800--20417299
132
3.8
132
97
0
919
25
22
19
32
1.98
20417272--20417325
26
2.0
26
89
3
81
24
29
12
33
1.92
20417239--20417369
70
1.9
70
96
0
244
25
27
18
28
1.98
20417299--20417503
44
4.7
43
75
13
193
25
25
19
29
1.99
20417107--20417501
202
2.0
202
95
0
718
25
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1.98
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274
24
22
22
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1.99
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44
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43
74
8
308
21
19
22
36
1.95
20417881--20418297
43
9.6
44
71
8
214
20
20
21
36
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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