Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  306  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Period
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Indels
Score
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Period
Size
Copy
Number
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Score
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1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
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Indels
Score
A
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(0-2)
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2
82
0.89
90941304--90941357
28
2.0
27
88
3
81
5
11
1
81
0.93
90945125--90945159
17
2.1
17
100
0
70
48
11
11
28
1.74
90947060--90947276
46
4.7
46
90
1
301
39
15
23
21
1.91
90947011--90947276
138
2.0
130
85
7
354
38
15
24
21
1.92
90955458--90955637
47
3.8
49
79
15
200
28
29
20
21
1.98
90955466--90955637
94
1.8
93
93
1
299
28
29
20
20
1.98
90956055--90956114
30
2.0
30
87
6
86
28
26
8
36
1.85
90963012--90963191
47
3.8
49
79
15
200
28
29
20
21
1.98
90963020--90963191
94
1.8
93
93
1
299
28
29
20
20
1.98
90963610--90963669
30
2.0
30
87
6
86
28
26
8
36
1.85
90964969--90965012
20
2.2
20
83
0
52
31
18
31
18
1.95
90965754--90965800
24
2.0
24
83
8
60
70
4
2
23
1.16
90966154--90966202
18
2.7
19
87
6
59
38
16
14
30
1.88
90970016--90970066
25
2.0
25
100
0
102
33
7
15
43
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90978891--90979051
51
3.2
51
94
0
286
31
22
13
33
1.92
90983995--90984041
6
8.2
6
77
17
55
0
2
12
85
0.70
90983995--90984037
17
2.5
17
88
7
61
0
2
11
86
0.67
90983995--90984041
11
4.2
11
76
15
51
0
2
12
85
0.70
90983995--90984041
18
2.7
18
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9
62
0
2
12
85
0.70
90989112--90989150
17
2.2
18
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4
53
15
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25
12
1.81
90991343--90991437
47
2.0
47
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0
181
29
24
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40
1.80
90991905--90991936
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2.8
12
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34
0
0
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0.93
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2.1
30
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0
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1.47
90992604--90992636
16
2.0
17
88
5
50
33
18
0
48
1.48
90999624--90999649
12
2.2
12
100
0
52
15
0
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1.33
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5.0
9
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2
56
30
15
15
39
1.88
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38
2.0
38
97
0
145
41
9
20
28
1.83
91010586--91010668
10
7.5
11
74
14
64
22
2
0
74
0.93
91010614--91010656
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7.3
6
82
12
54
11
4
0
83
0.78
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17
1.9
17
100
0
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12
3
0
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0.72
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22
3.0
23
76
12
59
20
2
0
76
0.92
91014622--91014658
15
2.5
16
87
12
53
21
24
10
43
1.84
91021228--91021501
86
3.2
84
69
14
234
36
19
17
26
1.93
91021297--91021590
87
3.4
87
68
11
242
35
18
18
28
1.94
91021183--91021717
175
3.1
175
90
2
853
34
19
18
27
1.95
91023495--91023555
12
4.9
12
73
15
52
26
1
1
70
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91027733--91027781
10
4.9
10
82
9
64
20
6
2
71
1.18
91030306--91030501
27
7.3
26
87
3
257
27
20
9
42
1.82
91030306--91030501
81
2.4
81
90
1
304
27
20
9
42
1.82
91030510--91030663
27
5.7
27
82
4
150
37
18
19
24
1.94
91030510--91030677
54
3.1
53
83
3
185
37
19
19
23
1.94
91030518--91030678
80
2.0
80
80
6
182
37
19
19
22
1.94
91030880--91030962
25
3.4
25
80
6
80
33
19
20
26
1.96
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11
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0
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0
7
0
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0.38
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8.4
27
82
4
287
27
20
9
42
1.83
91033364--91033589
54
4.2
54
90
2
330
27
20
9
42
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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