Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  4  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1034067--1034213
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72
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0
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2.0
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0
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2.4
75
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23
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1.90
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167
32
11
23
32
1.90
1055839--1055909
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2.0
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2.3
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10
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48
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3.8
46
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28
28
21
21
1.99
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1.97
1078308--1078515
93
2.1
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8
228
25
16
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28
1.97
1087616--1087790
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3.8
46
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13
205
29
29
20
20
1.97
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1.8
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2.1
29
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0
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0
50
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0
0
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1
0
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1.11
1111370--1111491
49
2.6
47
73
22
112
50
3
0
45
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1120306--1121010
124
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3
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8
12
30
1.69
1120303--1121008
245
2.9
244
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5
881
49
8
11
30
1.68
1128402--1128467
31
2.1
32
88
2
98
42
1
1
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1.18
1128428--1128466
19
2.0
20
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5
71
41
0
0
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16
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20
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70
0
1
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4.5
6
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0
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18
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14
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5.0
51
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15
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1.87
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2
28.5
2
100
0
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49
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1.00
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2
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4
10
43
1.60
1149846--1149974
50
2.5
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90
5
199
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16
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1.94
1149950--1150057
31
3.5
31
92
0
180
30
18
27
23
1.98
1151198--1151365
35
4.6
35
85
7
185
33
23
10
32
1.89
1151193--1151365
75
2.4
73
83
9
210
33
23
10
32
1.89
1152793--1153007
47
4.7
46
80
8
152
28
15
26
29
1.96
1152844--1153006
49
3.5
48
83
9
191
27
14
28
29
1.95
1152887--1153050
42
3.7
43
82
9
172
28
14
28
29
1.95
1158048--1158110
26
2.7
22
71
19
56
1
25
3
69
1.12
1158290--1158353
3
21.3
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100
0
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0
0
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20
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62
20
0
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1.10
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28
0
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21
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5
62
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5
0
51
1.24
1178059--1178160
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3.2
33
87
5
145
38
8
1
50
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1178078--1178159
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2.6
31
90
3
119
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1
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1.44
1187569--1187745
50
3.5
50
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2
257
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16
21
26
1.94
1187723--1187924
31
6.5
31
90
0
305
28
18
26
26
1.98
1187930--1187958
7
4.1
7
100
0
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44
13
27
13
1.82
1187962--1188087
47
2.7
48
87
2
175
30
15
24
29
1.96
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48
2.0
48
96
0
178
19
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3
38
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4.2
14
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10
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37
0
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57
1.21
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23
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72
25
13
4
56
1.56
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1.9
18
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52
61
0
2
35
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2
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51
0
0
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1.00
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1.12
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2
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6
59
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0
51
0
1.00
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16
57
45
5
1
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1.34
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24
2.6
26
69
16
66
47
4
0
47
1.22
1231489--1231542
24
2.2
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1
18
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1.9
18
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11
52
69
0
0
30
0.88
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3
100
0
50
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0
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1.58
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1.9
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196
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17
17
1.89
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2.0
99
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24
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16
18
1.91
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24
1.9
24
90
0
74
26
41
13
19
1.88
1242835--1243113
99
2.9
99
78
8
254
25
40
15
18
1.90
1242954--1243177
93
2.4
93
80
4
236
23
42
15
18
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1245549--1245585
15
2.5
15
100
0
74
10
51
16
21
1.74
1245547--1245588
15
2.5
17
81
18
61
9
52
14
23
1.71
1254449--1254489
17
2.3
19
83
8
50
36
0
4
58
1.20
1255623--1255665
21
2.0
22
90
4
70
32
2
6
58
1.38
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0
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15
14
24
1.82
1268246--1268408
35
4.5
35
82
10
177
31
25
11
31
1.90
1268237--1268408
75
2.4
73
83
10
210
32
23
11
31
1.91
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5
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55
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0
75
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24
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66
50
0
4
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1.20
1285053--1285081
2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
1286307--1286340
12
2.8
12
100
0
68
23
8
26
41
1.83
1287261--1287313
19
2.8
20
80
8
56
58
0
7
33
1.26
1287715--1287770
10
5.8
10
79
8
71
39
1
0
58
1.08
1287715--1287802
19
4.8
19
77
12
87
34
3
0
62
1.12
1287714--1287786
29
2.6
29
79
14
73
36
2
0
60
1.11
1287715--1287799
9
9.4
9
72
20
63
34
2
0
63
1.07
1291008--1291054
25
1.9
24
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12
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6
10
17
1.43
1296843--1296897
22
2.3
22
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12
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29
1
5
63
1.27
1302827--1302867
18
2.2
19
91
4
66
41
0
0
58
0.98
1303625--1303681
21
2.7
21
74
15
64
50
3
0
45
1.18
1305456--1305501
2
23.0
2
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0
83
50
2
0
47
1.13
1307141--1307174
14
2.5
13
86
13
50
17
0
17
64
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1307313--1307353
18
2.2
20
86
8
59
19
0
14
65
1.26
1307528--1307572
22
2.0
24
86
8
67
17
4
4
73
1.17
1324185--1324270
46
1.9
44
90
4
136
32
13
24
29
1.94
1324178--1324292
44
2.6
45
84
2
133
35
13
21
28
1.92
1328963--1329043
18
4.5
18
77
0
72
37
7
38
17
1.78
1328973--1329037
15
4.1
15
77
11
58
32
7
40
20
1.80
1329030--1329064
15
2.3
15
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0
52
45
2
45
5
1.41
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0
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0
0
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1.00
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13
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4
52
55
0
0
44
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2.0
25
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52
2
0
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1.12
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5.0
46
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21
24
15
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2.0
38
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0
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0
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1.12
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2.1
23
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2
4
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1.29
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0
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0
0
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22
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0
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7
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10
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0
0
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22
2.3
21
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9
57
39
1
3
54
1.30
1366599--1366675
31
2.5
32
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15
85
46
0
2
50
1.15
1366620--1366656
19
1.9
20
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48
0
0
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1381620--1381750
62
2.1
62
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2
158
44
12
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35
1.72
1384324--1384376
17
3.1
17
72
5
54
28
15
1
54
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1384646--1384683
16
2.2
17
81
13
51
26
5
2
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1.27
1384900--1385008
52
2.1
53
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1
184
24
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1389685--1389710
7
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7
100
0
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0
11
0
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2.0
15
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0
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0
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0
0
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1.00
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0
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2
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10
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50
0
0
50
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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