Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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This is table  323  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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1.92
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1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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47
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95045774--95045817
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15
55
76
1
3
18
0.99
95054508--95054585
37
2.1
38
81
9
90
75
2
2
19
1.03
95056584--95056628
2
22.5
2
90
0
72
53
2
0
44
1.13
95062353--95062393
21
2.0
21
90
9
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34
0
4
60
1.18
95062465--95062533
34
2.0
34
100
0
138
33
14
14
37
1.87
95066079--95066116
19
2.1
19
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5
69
50
0
0
50
1.00
95066523--95066560
19
2.0
19
100
0
76
31
15
21
31
1.94
95067566--95067611
23
2.0
23
82
0
56
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4
0
17
0.91
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2
10
2
0.80
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0
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4
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40
1.66
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29
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29
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16
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24
19
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2
17.5
2
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0
61
51
0
0
48
1.00
95090904--95092024
477
2.3
478
87
3
1569
38
21
16
23
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95090904--95092024
162
7.0
162
85
4
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38
21
16
23
1.92
95090905--95092024
317
3.5
318
84
4
1375
38
21
16
23
1.92
95092621--95092671
25
2.0
25
85
7
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54
5
3
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1.43
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2
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2
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0
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0
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0
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1.87
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22
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1.91
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22
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5
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4
0
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1.15
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1.84
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1.9
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1.74
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1.9
23
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13
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4
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1.62
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0
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0
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1.00
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2.3
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1
0
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1.10
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2.7
42
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30
25
13
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26
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27
1.99
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26
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10
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0
0
40
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2.8
21
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2
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42
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1
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1.59
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14
2.9
15
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7
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43
2
19
1.64
95149092--95149141
22
2.3
21
82
3
64
46
32
0
22
1.52
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1.9
25
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0
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1.51
95149416--95149450
15
2.4
15
90
4
54
45
34
0
20
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95149418--95149489
22
3.3
21
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48
27
0
23
1.51
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40
3.3
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120
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19
24
32
1.98
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1.9
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0
0
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2.1
22
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0
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2.3
23
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6
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15
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1.9
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0
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0
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0
0
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126
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15
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95166793--95166824
16
2.0
16
100
0
64
25
6
18
50
1.70

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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