Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  78  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25990346--25990555
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2
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25992827--25992991
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79
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0
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2.0
40
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18
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1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.20
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32
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22
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2
16
47
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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1.89
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3.9
15
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17
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1.80
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1
5
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1
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1
62
1.24
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1.26
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90
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0
70
0
29
0.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26143662--26143766
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2
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33
1.23
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16.7
9
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1.22
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19
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2
0
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1.17
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10
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2
0
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1.18
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88
87
3
244
30
8
20
40
1.82
26145080--26145264
88
2.1
87
82
3
237
34
7
18
39
1.79
26145089--26145287
88
2.3
87
83
7
217
33
8
19
39
1.81
26146755--26146792
13
3.1
13
85
11
53
60
5
0
34
1.19
26149184--26149285
11
8.8
11
67
14
62
62
5
3
27
1.36
26153698--26153745
24
2.0
24
100
0
96
45
4
20
29
1.70
26159820--26160229
203
2.0
203
98
0
786
27
17
18
37
1.93
26175062--26175374
125
2.5
125
88
1
448
38
18
15
27
1.91
26175930--26175981
25
2.0
26
85
3
70
61
3
3
30
1.32
26181016--26181085
24
3.1
21
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15
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55
5
11
27
1.57
26181015--26181076
24
2.8
22
75
7
63
58
3
11
27
1.48
26181438--26181483
24
1.9
24
90
0
74
23
2
47
26
1.63
26184649--26184688
14
2.7
15
80
7
55
52
5
0
42
1.23
26186789--26186824
18
2.0
18
88
0
54
61
0
5
33
1.19
26192671--26192718
22
2.2
22
84
0
60
50
2
4
43
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26197225--26197282
29
2.0
29
96
0
107
20
8
32
37
1.83
26198248--26198429
87
2.1
87
97
1
348
20
20
14
45
1.85
26202110--26202148
18
2.1
19
85
4
53
56
2
0
41
1.13
26203016--26203050
16
2.2
16
94
0
61
62
0
0
37
0.95
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8
5.0
8
84
3
53
56
0
0
43
0.99
26210972--26211024
26
2.1
25
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16
65
47
0
28
24
1.52
26221777--26221807
15
2.1
15
93
0
53
77
0
19
3
0.90
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21
2.2
21
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11
60
32
10
30
26
1.90
26224509--26224567
27
2.2
27
84
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75
47
0
3
49
1.18
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3.0
43
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6
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33
22
26
18
1.96
26227551--26227646
41
2.3
41
92
0
165
30
22
27
19
1.98
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18
2.5
19
75
24
51
29
4
22
43
1.73
26228419--26228463
14
3.2
14
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0
63
20
0
28
51
1.48
26228809--26228846
15
2.4
16
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4
51
73
0
0
26
0.83
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2.7
21
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10
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0
3
21
0.95
26231232--26231344
40
2.8
40
85
1
138
26
31
21
20
1.98
26234633--26234678
21
2.2
21
84
0
56
45
2
21
30
1.64
26236727--26236759
6
5.0
7
85
14
52
45
9
0
45
1.35
26236725--26236759
13
2.7
13
100
0
70
42
8
0
48
1.33
26236952--26237012
33
1.9
32
93
6
106
19
21
24
34
1.96
26237898--26237926
10
2.9
10
100
0
58
41
17
0
41
1.49
26242035--26242076
9
4.7
9
82
8
50
42
9
0
47
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26242028--26242073
19
2.4
19
79
13
58
45
10
0
43
1.39
26243488--26243560
35
2.1
35
100
0
146
19
17
8
54
1.67
26245090--26245141
22
2.5
22
75
6
54
51
0
1
46
1.12
26245740--26245799
22
2.7
22
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7
59
46
0
1
51
1.10
26246506--26246539
17
1.9
18
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58
0
5
35
1.22
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0
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0
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0
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0
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0
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197
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9
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1.79
26260072--26260150
39
2.0
39
92
0
131
43
3
27
25
1.72

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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