Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  26  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2
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2.5
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1.95
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473
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17
19
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1.95
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1.8
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9.7
77
75
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28
17
19
35
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
30
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19
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3.8
30
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1.65
9704765--9704877
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201
25
49
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1.65
9704765--9704861
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15
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2
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1.37
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2.3
71
97
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28
18
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1.95
9713977--9714174
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2.8
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20
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2.8
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27
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2.0
60
88
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2
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0
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2.1
24
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4
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2.4
47
84
6
154
25
16
23
35
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9825439--9825485
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32
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90
32
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1
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21
2.0
21
90
0
64
26
21
29
21
1.99
9853689--9853724
4
9.0
4
93
0
63
27
0
22
50
1.50
9854810--9854881
10
7.3
9
74
18
56
30
2
2
63
1.22
9854809--9854924
19
5.8
18
69
18
61
35
1
2
60
1.21
9854852--9854912
20
3.2
19
75
9
52
42
0
3
54
1.17
9855046--9855108
32
2.0
32
87
6
92
38
19
12
30
1.89
9855250--9855281
15
2.1
16
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5
57
75
0
0
25
0.81
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2
17.5
2
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0
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48
0
0
51
1.00
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4
27
1.30
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10
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10
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76
0
3
20
0.94
9863248--9863309
7
8.9
7
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20
51
75
0
4
19
0.97
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27
2.6
29
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14
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75
0
5
18
0.99
9863236--9863310
37
2.1
35
82
7
98
76
0
4
20
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9863255--9863311
30
1.9
29
89
10
89
75
0
7
17
1.02
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27
2.3
27
91
2
108
30
17
12
39
1.87
9870254--9870388
25
5.5
25
80
6
161
20
26
17
34
1.95
9870254--9870428
25
7.4
23
78
8
131
19
26
18
35
1.95
9870254--9870428
47
3.7
46
84
7
201
19
26
18
35
1.95
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4.4
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13
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54
0
0
45
1.00
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2
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2
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51
0
0
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1.00
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14
189
20
20
29
29
1.98
9891271--9891442
93
1.8
93
92
2
292
20
20
29
28
1.98
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1.9
16
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0
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3
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0
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2.0
100
99
0
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18
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18
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53
2
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1.34
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2
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0
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0
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0
1.00
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0
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25
16
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1.95
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47
2.4
47
84
6
154
25
16
23
35
1.95
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47
2.4
47
84
6
154
35
23
16
25
1.95
9964353--9964463
47
2.4
47
84
6
154
35
23
16
25
1.95
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12
2.2
12
100
0
54
40
25
7
25
1.82
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24
2.1
24
82
7
59
68
3
0
27
1.07
9969489--9969583
48
2.0
48
97
0
181
32
21
16
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9969537--9969677
72
2.0
72
100
0
282
32
18
16
32
1.93
9969807--9969840
13
2.5
13
90
4
50
58
8
11
20
1.59
9969862--9969967
54
1.9
54
83
9
135
37
18
15
28
1.91
9969682--9970300
139
4.5
140
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2
1094
37
20
16
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1.93
9970233--9970398
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2.3
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41
21
15
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1.89
9970273--9970519
122
2.0
124
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3
383
39
22
13
24
1.90
9970398--9970572
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2.5
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5
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22
14
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2.3
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100
0
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2
2
31
1.16
9980390--9980441
8
6.5
8
82
8
61
65
1
1
30
1.14

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335