Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  34  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1
0.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
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2.1
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1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
Percent
Indels
Score
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(0-2)
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50
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186
46
24
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22
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12773641--12773916
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138
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13
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0
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0.99
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18
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3
0
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74
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0
0.67
12790113--12790166
6
9.0
6
91
6
67
0
0
14
85
0.61
12790709--12790753
19
2.3
20
84
3
56
60
4
2
33
1.29
12791927--12791957
16
2.0
16
93
6
55
48
0
0
51
1.00
12793789--12794030
41
6.0
41
86
1
290
34
23
18
23
1.96
12793774--12794040
81
3.3
81
83
2
331
32
24
18
23
1.97
12793774--12794027
122
2.1
121
85
1
330
33
23
18
24
1.97
12794325--12794380
29
1.9
29
85
7
78
50
23
0
26
1.50
12794325--12794391
28
2.4
28
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7
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52
22
0
25
1.47
12794572--12794661
43
2.0
44
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4
119
27
7
26
37
1.84
12795709--12795803
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46
18
15
18
1.84
12796655--12796689
2
17.5
2
100
0
70
48
0
0
51
1.00
12796775--12796804
14
2.1
15
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6
53
50
13
0
36
1.42
12799614--12799646
2
16.5
2
100
0
66
48
0
0
51
1.00
12800742--12800869
9
13.6
9
75
12
114
46
20
0
32
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12800759--12800836
39
2.0
39
97
0
147
46
21
0
32
1.52
12800755--12800867
57
2.0
57
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0
181
46
22
0
30
1.58
12806720--12806801
31
2.5
33
80
7
96
14
2
19
63
1.41
12806928--12806959
16
2.0
16
100
0
64
25
25
18
31
1.98
12807780--12807830
25
2.1
24
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47
3
1
47
1.32
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25
2.0
25
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3
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57
0
3
38
1.17
12809580--12809634
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2.1
26
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6
76
56
0
3
40
1.17
12817941--12818111
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1.8
93
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0
315
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30
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20
1.98
12817932--12818107
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3.8
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28
29
21
20
1.98
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2.8
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27
25
0
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1.52
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18
2.2
19
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12
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24
0
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1.53
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21
4.0
21
80
4
80
38
25
21
14
1.91
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21
3.5
22
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7
91
38
26
21
13
1.90
12821171--12821210
2
20.0
2
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0
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0
2
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2
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50
0
0
50
1.00
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0
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0
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0.95
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10
232
20
21
29
28
1.98
12823882--12824053
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1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
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8.7
3
100
0
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0
0
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3.8
46
78
13
189
20
21
29
28
1.98
12837275--12837448
46
3.8
46
79
13
214
20
21
29
28
1.98
12840392--12840470
15
5.4
15
77
8
83
10
18
13
56
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12840383--12840469
30
3.0
30
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12
92
10
18
16
55
1.69
12842853--12843028
46
3.8
46
80
12
225
21
21
28
28
1.98
12842849--12843020
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
12849990--12850100
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2.4
47
83
6
145
36
22
14
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1.92
12858528--12858594
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24
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43
2
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1.9
21
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0
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1.00
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14
100
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14
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13
4.5
13
89
0
91
28
6
22
42
1.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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