Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  250  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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G
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2
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6
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53
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
(0-2)
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449
26
27
20
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76094801--76095152
120
2.9
120
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27
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1.99
76096982--76097067
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2.3
36
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138
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19
1.96
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23
71
12
61
62
10
1
25
1.34
76115480--76115557
5
15.0
5
72
17
52
57
2
2
37
1.26
76115442--76115557
27
4.4
25
73
19
85
56
3
2
37
1.30
76120945--76121030
36
2.3
36
90
9
138
26
33
19
19
1.96
76121099--76121373
49
5.6
49
96
0
478
30
27
7
34
1.84
76124342--76124482
40
3.5
40
80
10
128
26
26
21
24
2.00
76125226--76125497
40
6.8
40
89
0
391
26
27
20
25
1.99
76127305--76127391
37
2.3
36
90
5
129
26
33
19
20
1.97
76127460--76127734
49
5.6
49
96
2
493
29
28
7
34
1.84
76130280--76130338
28
2.1
28
93
0
100
32
16
16
33
1.92
76133614--76133907
49
6.0
49
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0
534
33
8
28
29
1.87
76133964--76134083
37
3.2
37
91
4
197
23
19
33
24
1.97
76138695--76138755
30
2.0
30
100
0
122
44
22
0
32
1.54
76139608--76139647
20
2.1
19
85
4
53
55
7
0
37
1.29
76140384--76140573
88
2.2
88
84
3
253
34
21
8
35
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76140670--76140734
18
3.7
18
74
10
71
64
3
4
27
1.28
76140967--76141089
56
2.2
57
82
2
142
34
3
0
61
1.18
76142203--76142249
19
2.5
19
96
0
85
27
42
21
8
1.81
76143386--76143540
26
6.2
26
69
17
98
40
20
18
20
1.92
76149081--76149247
52
3.2
52
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5
192
31
27
14
25
1.95
76151861--76151914
28
1.9
28
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7
65
37
3
3
55
1.35
76155564--76155602
19
2.1
19
85
0
51
51
0
2
46
1.14
76155590--76155655
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2.2
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0
0
45
0.99
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16
3.2
16
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50
0
0
50
1.00
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3.7
46
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9
183
21
27
20
30
1.98
76166227--76166401
94
1.9
92
83
7
228
21
27
21
29
1.98
76166737--76166818
30
2.8
30
88
1
121
32
28
9
29
1.89
76170511--76170559
22
2.2
22
85
0
71
32
10
28
28
1.90
76172030--76172087
24
2.4
24
73
0
62
20
20
17
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1.90
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3.1
8
100
0
50
12
0
0
88
0.53
76188745--76189058
46
6.7
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10
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25
28
18
27
1.98
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26
4.2
26
92
0
175
31
6
25
36
1.81
76198623--76198772
75
2.0
75
94
0
264
39
18
11
31
1.86
76207712--76207740
8
3.6
8
100
0
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37
0
0
62
0.96
76207763--76207799
5
7.4
5
100
0
74
40
0
0
59
0.97
76207807--76207850
21
2.2
20
87
4
61
65
6
20
6
1.39
76209070--76209126
15
3.9
15
90
2
89
36
0
12
50
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76209498--76209603
21
4.9
22
85
6
119
14
21
26
37
1.92
76209500--76209603
42
2.4
43
83
3
147
14
21
26
37
1.92
76211783--76211856
32
2.3
31
81
4
85
54
18
2
24
1.57
76212307--76212345
19
2.0
20
95
5
71
25
23
10
41
1.86
76214230--76214261
10
2.8
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50
50
0
0
50
1.00
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23.5
2
95
0
85
48
0
2
48
1.13
76224434--76224465
14
2.2
15
94
5
57
25
37
12
25
1.91
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359
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19
18
34
1.95
76224453--76224981
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89
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8
438
27
19
18
34
1.95
76224455--76224984
140
3.9
136
82
8
553
27
19
18
34
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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