Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  329  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Copy
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Indels
Score
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1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Indels
Score
A
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(0-2)
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150
10.2
156
73
16
655
32
20
16
30
1.95
96792357--96792586
85
2.7
86
79
10
258
35
18
15
31
1.92
96792527--96792944
72
5.7
74
83
7
428
33
20
16
29
1.95
96792552--96793909
167
8.7
145
73
15
528
32
20
17
30
1.95
96792880--96793061
90
2.0
90
84
6
235
33
20
20
25
1.97
96793295--96793915
75
8.1
75
76
11
544
30
20
17
30
1.96
96793533--96793709
92
2.0
89
82
7
214
31
19
19
29
1.96
96793376--96793860
242
2.0
239
87
4
697
31
20
17
30
1.96
96793879--96794099
54
3.9
53
68
18
151
38
20
14
26
1.91
96794063--96794221
72
2.2
73
87
3
223
34
23
15
25
1.95
96794237--96794396
71
2.4
68
82
9
177
33
25
13
26
1.94
96802402--96802433
16
1.9
17
93
6
57
40
6
28
25
1.79
96804420--96804450
2
15.5
2
93
0
53
48
0
3
48
1.17
96806075--96806127
22
2.3
23
76
20
58
66
5
3
24
1.31
96806155--96806215
30
2.1
29
84
9
79
62
6
6
24
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96806259--96806309
20
2.4
22
83
6
70
64
0
1
33
1.05
96806261--96806309
23
2.2
22
85
10
64
63
0
2
34
1.06
96807903--96808171
83
3.2
83
89
0
403
26
19
20
33
1.96
96808095--96808528
119
3.6
119
96
0
787
27
21
18
32
1.97
96820625--96820685
30
2.1
29
84
9
79
62
6
6
24
1.44
96820731--96820787
3
17.7
3
75
13
51
61
3
1
33
1.23
96820731--96820787
10
5.9
9
76
13
51
61
3
1
33
1.23
96820729--96820787
20
2.8
20
78
14
66
62
3
1
32
1.21
96820731--96820777
23
2.0
23
88
8
69
63
0
2
34
1.06
96821920--96821987
33
2.1
33
100
0
136
16
11
26
45
1.81
96823511--96823630
53
2.3
53
92
0
195
27
19
25
28
1.98
96823511--96823661
53
2.8
52
86
7
187
26
17
26
29
1.97
96825909--96825954
3
15.3
3
100
0
92
32
0
0
67
0.91
96826661--96826691
15
2.1
15
100
0
62
51
12
12
22
1.74
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1
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1
93
0
53
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3
0
0
0.21
96828176--96828200
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
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2.1
33
94
0
120
23
14
2
59
1.49
96828951--96828995
19
2.4
20
85
10
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33
0
2
64
1.06
96833660--96833935
136
2.0
135
93
2
473
29
18
14
37
1.90
96834230--96834259
14
2.2
14
94
5
53
6
13
6
73
1.24
96834882--96834913
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2.0
16
93
0
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31
9
25
34
1.87
96836910--96836942
11
2.8
12
81
9
50
33
6
0
60
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96840101--96840145
22
2.0
22
82
0
54
31
15
4
48
1.65
96845759--96845818
30
2.0
30
86
0
84
43
5
23
28
1.74
96848867--96848948
43
1.9
43
92
2
139
15
19
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40
1.91
96872475--96872753
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3.8
73
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5
352
27
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1.96
96872801--96873150
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4.9
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8
323
24
16
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96872793--96873078
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2.0
144
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0
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96876594--96876642
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3.0
17
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6
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13
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0
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100
0
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0
0
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13
3.1
13
88
0
62
45
5
2
47
1.38

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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