Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  37  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Indels
Score
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G
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13713092--13713261
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10
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Score
A
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(0-2)
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1.23
13835544--13835602
31
1.9
30
83
16
77
52
3
1
42
1.28
13843756--13843847
36
2.6
34
79
14
114
42
20
6
30
1.77
13845442--13845467
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
13847754--13847780
6
4.5
6
100
0
54
48
14
18
18
1.82
13847713--13847831
51
2.3
51
87
5
161
42
17
17
21
1.89
13849108--13849236
53
2.4
53
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2
197
27
27
17
27
1.97
13856288--13856427
53
2.6
53
88
2
201
29
27
17
25
1.98
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2.2
48
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19
118
27
27
17
26
1.98
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13
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18
5
0
76
0.97
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25
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24
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2
0
50
1.14
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1
0
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1.09
13859898--13859972
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24
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1
0
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0
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2
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2
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0
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0
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0
1.00
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2
14.5
2
100
0
58
51
0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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0
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0
0
50
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19
2.0
19
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0
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15
15
15
1.75
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4
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13
24
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1.93
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44
2.6
44
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2
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13
22
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1.92
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4
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35
14
23
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1.93
13897500--13897614
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2.6
44
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2
149
35
13
22
27
1.92
13897500--13897633
46
3.0
45
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4
153
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14
23
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1.93
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1.93
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0
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0
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8
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15
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1.94
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7
165
18
24
22
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10
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18
24
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35
1.96
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87
1
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18
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21
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27
25
0
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24
0
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28
28
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23
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2.0
17
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50
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12
0
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18
2.1
19
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48
10
0
41
1.37
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5
10.0
5
80
11
61
56
1
0
41
1.10
13926777--13926832
12
4.5
12
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16
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1
0
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1.10
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6
4.8
6
100
0
58
17
0
0
82
0.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13936300--13936379
21
3.7
21
76
8
81
48
1
1
48
1.17
13936352--13936396
16
2.7
17
79
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56
46
0
0
53
1.00
13937264--13937333
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0
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1.60
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2
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100
0
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0
0
48
1.00
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0
0
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0
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4.7
6
100
0
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46
0
0
53
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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