Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  81  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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Period
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A
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4
30
1.56
27054771--27054813
2
21.5
2
100
0
86
51
0
0
48
1.00
27060733--27060776
21
2.0
22
87
12
65
45
2
0
52
1.13
27067718--27067890
93
1.9
93
92
0
292
27
28
21
22
1.99
27067711--27067886
46
3.8
46
81
10
214
28
27
21
22
1.99
27071146--27071253
53
2.0
53
98
0
207
44
8
7
39
1.63
27076344--27076406
23
2.9
22
76
13
67
23
1
6
68
1.22
27078715--27078780
24
2.8
24
88
6
91
21
15
16
46
1.83
27078878--27078907
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
27084058--27084167
26
4.2
26
95
0
175
34
5
23
36
1.78
27085646--27085698
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2.0
26
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37
22
15
24
1.92
27088816--27088847
14
2.3
14
94
0
55
53
0
15
31
1.43
27098608--27098641
13
2.5
14
85
4
52
73
2
2
20
1.09
27111928--27111959
14
2.3
14
94
0
55
31
0
15
53
1.43
27119819--27119851
6
5.5
6
100
0
66
51
0
15
33
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27126479--27126562
42
2.0
42
88
0
123
20
38
10
30
1.87
27136248--27136345
33
3.0
33
83
3
108
19
11
16
53
1.73
27154658--27154922
46
5.7
47
87
3
360
20
22
13
43
1.87
27154658--27154921
138
1.9
138
89
0
411
20
22
14
43
1.87
27156771--27156818
11
4.2
11
79
10
51
62
2
0
35
1.07
27157405--27157465
22
2.4
25
80
19
74
42
19
1
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1.61
27165544--27165725
87
2.1
87
94
0
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20
30
19
29
1.97
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11
6.4
11
77
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40
0
4
55
1.19
27168197--27168229
4
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4
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0
66
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0
0
51
1.00
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2.4
54
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15
135
29
15
20
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1.93
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11
3.3
10
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0
0
36
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11
2.7
11
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5
51
58
0
0
41
0.98
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19
2.1
21
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63
60
2
0
37
1.10
27174080--27174123
19
2.2
21
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59
0
4
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2
29
1.15
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29
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2
2
32
1.23
27174141--27174202
27
2.2
28
82
5
72
67
1
3
27
1.15
27174680--27174724
24
2.0
23
82
8
56
62
0
8
28
1.25
27180178--27180250
31
2.3
31
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2
83
43
13
12
30
1.81
27186359--27186419
17
3.5
17
80
6
68
50
1
0
47
1.10
27186410--27186488
38
2.1
39
85
2
106
49
1
1
48
1.17
27186435--27186489
20
2.8
20
79
15
71
50
0
0
49
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27186449--27186527
11
6.9
12
70
21
55
49
0
1
49
1.09
27186416--27186526
57
1.9
57
79
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124
51
0
1
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1.17
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18
1.9
18
88
0
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37
25
0
37
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11
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0
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0
0
38
0.96
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147
39
17
21
22
1.93
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47
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47
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37
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22
1.94
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23
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22
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5
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1.58
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9
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10
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2
4
21
1.14
27208561--27208610
20
2.5
20
90
6
75
72
2
6
20
1.16

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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