Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  79  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26260923--26260966
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0
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0
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0
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7.2
70
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19
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1.94
26301674--26302191
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140
91
5
840
32
16
19
31
1.94
26301674--26302191
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2.4
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1000
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194
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3.0
35
95
0
194
16
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0
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21
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2.6
86
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21
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1.99
26312595--26312822
43
5.3
43
81
5
255
24
21
28
25
1.99
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2.5
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61
18
3
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21
2.2
21
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0
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2
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19
28
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26318877--26319102
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18
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161
38
0
12
47
1.48
26318930--26319102
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6.2
27
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13
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1.9
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313
38
0
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0
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0
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0
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18
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29
19
23
1.98
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27
29
19
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1.98
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2.0
27
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1
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4
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2.7
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7
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1.44
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24.3
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4
2
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2.3
63
91
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26
14
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1.95
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7.3
75
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336
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19
15
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226
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18
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2.7
76
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32
21
17
28
1.96
26329963--26330202
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3.1
77
84
2
295
33
20
17
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
6
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1.39
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16
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15
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14
53
59
4
2
34
1.29
26342583--26342619
14
2.5
16
83
16
53
59
5
0
35
1.20
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0
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30
87
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88
51
1
6
40
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26384548--26384585
2
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2
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52
0
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0
0
11
0.52
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0
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82
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1
10
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26
2.4
24
83
13
73
66
3
0
29
1.08
26392890--26392930
21
2.0
21
90
0
64
68
26
0
4
1.10
26392889--26392934
11
4.4
11
78
8
51
71
23
0
4
1.03
26398561--26398631
33
2.2
32
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7
81
22
4
14
59
1.52
26399281--26399319
19
2.1
19
85
0
51
46
0
2
51
1.14
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9
5.1
9
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10
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2
0
52
1.13
26399354--26399397
16
2.6
16
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7
52
45
2
0
52
1.13
26399362--26399414
22
2.2
24
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1
0
49
1.12
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27
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1.92
26400140--26400172
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2.1
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0.80
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1.97
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40
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1.95
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20
2.2
21
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0
26
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73
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0
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60
0
0
39
0.97
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57
2.1
58
82
4
141
47
5
18
28
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26422574--26422628
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27
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10
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9
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32
1.56
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23
2.2
23
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0
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44
8
10
38
1.68
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20
2.0
21
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5
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47
5
5
42
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19
3.6
19
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12
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34
7
0
57
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1.9
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0
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7
0
56
1.27
26425351--26425419
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0
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1.27
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2.0
21
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0
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26
1.97
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28
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45
1.68
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11
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3
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1.9
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2.0
20
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0
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2.0
22
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0
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0
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95
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1.9
140
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0
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20
22
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5
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111
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0
0
40
0.97
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2.2
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28
26
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26
1.98
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1.93
26463374--26463455
44
1.9
41
83
11
103
34
26
24
14
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26463659--26463741
27
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28
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0
0
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0
0
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2.3
18
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4
66
66
0
0
33
0.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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