Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  65  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22647608--22647649
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11
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3.6
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1.66
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44
2.4
44
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3
144
29
23
13
33
1.93
22671515--22671562
22
2.2
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29
2
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21
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32
1.91
22672753--22672899
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2
204
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18
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2
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0
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0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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1.22
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1.9
21
85
10
55
30
5
0
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1.14
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31
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20
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63
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2.1
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2.0
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4.8
46
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93
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20
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2.0
23
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23
2.0
23
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40
13
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37
1.76
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21
2.3
21
88
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41
8
8
41
1.67
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15
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16
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18
0
2
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0.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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3
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0
0
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100
0
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0
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0
0
50
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18
22
1.93
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123
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18
20
1.93
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52
8
0
17
73
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22835030--22835087
18
3.3
17
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63
1
3
31
1.21
22835324--22835451
65
2.0
65
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195
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3
3
61
1.27
22837749--22837778
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92
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50
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0
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0
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2
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28
1.96
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2.6
72
93
1
312
32
22
16
28
1.96
22840120--22840632
199
2.6
196
86
4
692
32
22
16
28
1.96
22840326--22840556
123
1.9
126
86
2
333
34
22
15
28
1.94
22840487--22840712
76
2.9
78
88
5
323
31
23
16
27
1.96
22840499--22840712
81
2.8
76
89
5
313
29
24
17
28
1.97
22840716--22840746
16
1.9
16
93
0
53
64
6
12
16
1.47
22840650--22840910
89
2.9
88
91
2
425
36
20
16
26
1.94
22840815--22841050
73
3.2
73
82
1
319
33
20
17
28
1.95
22847549--22847590
9
4.8
9
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2
50
54
7
0
38
1.28
22847547--22847594
18
2.6
19
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54
8
0
37
1.31
22848114--22848148
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11
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0
1.16
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49
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49
89
4
147
44
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13
28
1.82
22851208--22851447
119
2.0
119
90
3
376
28
30
8
32
1.87
22859345--22859373
2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
22860124--22860153
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22862808--22862890
42
2.0
43
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2
132
28
6
2
62
1.31
22868062--22868374
46
6.8
46
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2
369
21
22
14
41
1.89
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138
2.2
139
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0
427
21
22
14
42
1.89
22874737--22874963
101
2.2
101
94
0
391
30
22
14
33
1.93
22874737--22874963
50
4.5
51
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1
323
30
22
14
33
1.93
22877634--22877783
62
2.4
62
88
0
228
30
20
25
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1.99
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39
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17
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22
1.93
22878024--22878191
46
3.7
46
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1
230
40
15
24
19
1.90
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2.0
51
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0
197
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6
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0
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15
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0
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0
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2.7
23
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15
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46
3
13
36
1.60
22887622--22887680
22
2.5
24
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8
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52
6
6
33
1.54
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25
2.3
24
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1
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26
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17
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55
4
7
31
1.49
22887791--22887836
25
1.9
25
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60
0
4
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1.16
22887702--22887836
45
2.8
49
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18
122
55
2
6
34
1.41
22888955--22889719
89
8.8
86
75
11
586
38
18
16
26
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22889163--22889211
14
3.5
14
94
0
89
59
6
18
16
1.57
22889089--22889283
101
1.9
100
92
3
329
40
17
17
24
1.90
22889200--22889338
74
1.9
72
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5
226
31
21
18
28
1.97
22889512--22889540
14
2.1
14
100
0
58
65
6
13
13
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22889684--22889746
14
4.5
14
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65
61
3
12
22
1.45
22889687--22889719
15
2.2
15
94
0
57
69
0
9
21
1.15
22889703--22889746
13
3.3
13
81
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52
63
4
13
18
1.46
22889877--22889911
14
2.5
14
95
0
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57
2
20
20
1.54
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19
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1.96
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2.3
75
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20
19
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14
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0
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2
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20
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18
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1.94
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2.4
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1562
36
18
18
26
1.94
22890135--22890377
87
2.8
84
85
10
307
35
19
17
26
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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