Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  62  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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1.49
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29
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0
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31
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
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1.9
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0
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2.0
31
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1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.74
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0
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0
0
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2.3
31
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92
23
12
18
45
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21988941--21988965
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0
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0
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0
0
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1.00
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11
2.8
11
90
0
53
64
0
9
25
1.24
22014517--22014594
34
2.3
34
82
4
95
30
10
15
43
1.80
22016392--22016416
5
5.0
5
100
0
50
20
60
0
20
1.37
22016704--22016780
27
2.9
26
88
3
127
58
2
3
35
1.30
22016707--22016792
27
3.2
25
78
21
95
55
3
4
36
1.37
22034700--22034754
25
2.3
23
78
12
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43
3
16
36
1.65
22034780--22034853
26
2.7
27
75
8
69
55
4
4
36
1.38
22035057--22035106
24
2.1
24
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0
64
46
4
8
42
1.52
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9
4.1
9
85
0
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2
0
37
1.12
22035156--22035193
18
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18
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2
0
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1.11
22035267--22035303
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19
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2
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30
2.5
29
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1
35
1.34
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12
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12
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19
50
57
7
1
32
1.36
22041365--22041539
46
3.8
46
78
13
205
29
29
20
20
1.98
22041372--22041543
93
1.8
93
94
0
308
28
29
20
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22070607--22070691
29
2.9
29
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13
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4
1
27
1.18
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13
3.8
13
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0
64
38
6
20
36
1.77
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20
2.5
20
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9
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70
0
4
26
1.05
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11
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16
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0
0
37
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2.1
22
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2
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1.22
22076456--22076501
20
2.3
20
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2
4
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1.21
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4.0
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0
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0
0
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18
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1.30
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0
0
60
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0
0
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0
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25
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20
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1
20
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1.04
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10.3
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0
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0
29
1.06
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2.0
27
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3
0
44
1.19
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20
2.2
19
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4
2
46
1.36
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10
22
33
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22098517--22098550
13
2.6
13
85
0
50
38
0
11
50
1.39
22100012--22100093
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2.9
28
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112
42
43
1
12
1.49
22101172--22101228
3
19.0
3
75
7
53
35
3
0
61
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22101170--22101222
18
2.9
18
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5
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39
3
0
56
1.17
22101164--22101223
9
6.6
9
81
9
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38
3
0
58
1.15
22101314--22101463
12
12.3
12
67
23
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32
3
4
60
1.31
22101308--22101403
26
3.9
24
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35
1
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1.31
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5.7
21
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25
70
33
2
5
58
1.34
22101412--22101451
21
1.9
21
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5
0
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1.14
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2
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1.22
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2
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2
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1.32
22105831--22105923
5
17.8
5
73
22
68
18
4
1
76
1.01

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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