Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  39  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14319787--14319823
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0
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0
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1.61
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2.0
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1
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0
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1.9
18
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0
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10
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37
30
15
16
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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70
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24
15
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26
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2.0
27
89
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43
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1.50
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4
0
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1.19
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2.3
18
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4
0
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1.21
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2.1
41
84
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36
2
2
58
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
21
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5
84
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5
19
27
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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92
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24
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3
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0
0
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0
12
0.53
14544660--14544707
23
2.1
23
81
11
55
60
2
0
37
1.09
14544773--14544858
44
2.0
44
100
0
172
32
6
11
48
1.66
14546833--14546930
36
2.6
37
73
12
103
47
2
1
48
1.19
14546911--14546965
24
2.3
23
75
9
56
50
1
0
47
1.11
14547129--14547158
15
1.9
16
93
6
53
60
0
0
40
0.97
14547138--14547200
23
2.7
23
80
9
58
61
3
1
33
1.21
14547154--14547200
22
2.1
23
84
4
60
61
4
2
31
1.27
14548660--14548697
18
2.1
19
90
5
60
52
0
0
47
1.00
14557288--14557346
24
2.5
24
91
0
91
76
3
11
8
1.13
14557665--14557704
9
4.3
9
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6
53
17
5
0
77
0.94
14558911--14558953
18
2.4
18
80
7
52
37
0
0
62
0.95
14560838--14561073
123
1.9
120
81
8
280
41
9
5
42
1.61
14570854--14571004
53
2.8
53
88
4
205
25
15
27
30
1.96
14591229--14591272
22
2.0
22
90
0
70
68
6
0
25
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14592764--14592817
26
2.0
27
82
10
67
53
0
7
38
1.29
14595582--14595627
15
3.3
13
85
14
65
58
2
2
36
1.22
14604121--14604208
21
4.1
22
77
10
92
35
26
23
14
1.94
14604126--14604207
44
1.9
41
82
7
101
32
28
24
14
1.94
14604399--14604516
23
4.6
26
86
7
131
45
33
4
16
1.67
14604413--14604515
51
1.9
53
84
11
138
44
32
3
19
1.69
14608834--14608887
25
2.2
24
93
3
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62
14
3
18
1.46
14610590--14610697
22
4.6
25
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9
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15
22
20
1.90
14611829--14611873
17
2.6
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53
0
4
42
1.21
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2
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2
100
0
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50
0
0
50
1.00
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23
2.0
22
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13
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13
4
4
77
1.08
14627377--14627470
46
2.0
46
100
0
188
37
6
19
37
1.77
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12
5.9
11
74
17
62
42
0
0
57
0.98
14633649--14633718
23
3.2
21
72
16
63
42
0
0
57
0.99
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3
9.0
3
100
0
54
66
0
0
33
0.92
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14
1.9
14
100
0
54
59
7
3
29
1.42
14640245--14640281
19
1.9
19
100
0
74
67
0
0
32
0.91
14640260--14640319
31
1.9
32
89
3
95
58
1
3
36
1.25
14643504--14643542
20
2.0
20
85
10
53
30
0
15
53
1.42
14645904--14645937
3
11.3
3
93
0
59
29
0
2
67
1.05
14646860--14647005
62
2.4
62
92
2
240
32
11
23
32
1.90
14655685--14655740
29
1.9
29
96
0
103
30
17
8
42
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14663181--14663563
131
2.9
131
84
5
434
33
19
18
27
1.96
14669114--14669173
31
2.0
31
90
3
95
56
11
6
25
1.59
14682256--14682315
23
2.5
23
78
5
57
70
6
10
13
1.34
14683243--14683292
3
16.7
3
95
0
82
32
4
0
64
1.12
14683986--14684055
26
2.6
25
76
10
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30
5
7
57
1.49
14687114--14687139
10
2.6
10
100
0
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7
0
0
92
0.39
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2.5
29
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11
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41
2
0
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1.14
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9
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3
0
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1.11
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19
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36
2
0
61
1.11
14694630--14694676
22
2.1
22
84
7
60
29
4
2
63
1.25

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335