Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  66  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22890316--22891780
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20.0
72
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0
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0
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2.0
76
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20
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44
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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2.0
26
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72
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2.3
21
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2.1
136
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30
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29
1.47
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5.1
21
68
24
58
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5
6
34
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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32
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18
22
29
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22
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18
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6
68
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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3
31
1.74
23014464--23014531
33
2.1
33
100
0
136
26
32
4
36
1.76
23017945--23017977
15
2.1
16
88
5
50
78
9
3
9
1.05
23018220--23018283
29
2.2
29
80
5
76
70
3
4
21
1.20
23018103--23018593
146
3.4
147
91
2
758
56
6
8
28
1.54
23018600--23019050
146
3.1
147
87
4
689
30
8
5
55
1.54
23019155--23019198
17
2.5
17
88
3
70
4
6
11
77
1.11
23020844--23020877
6
5.7
6
92
0
59
38
0
61
0
0.96
23025315--23025350
2
18.0
2
94
0
63
50
2
0
47
1.15
23040633--23040676
23
2.0
21
82
13
52
63
2
6
27
1.31
23040933--23040970
19
2.2
17
86
13
51
63
5
7
23
1.42
23040965--23041044
23
3.3
23
70
29
67
57
0
3
38
1.17
23040965--23041090
13
10.5
11
70
25
55
58
0
4
35
1.25
23041060--23041094
13
2.9
12
91
8
54
57
0
8
34
1.29
23041118--23041150
16
2.1
16
88
11
50
63
3
0
33
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23041106--23041164
18
3.2
19
80
9
68
64
1
0
33
1.04
23041106--23041160
20
2.8
20
78
15
62
63
1
0
34
1.05
23042800--23043692
206
4.3
206
91
2
1341
28
21
18
31
1.97
23051789--23051818
14
2.1
14
93
0
51
46
10
6
36
1.64
23055865--23055904
18
2.2
19
86
13
57
65
5
7
22
1.38
23055899--23055978
23
3.3
23
70
29
67
57
0
3
38
1.17
23055899--23056001
13
8.6
11
71
25
52
58
0
3
36
1.23
23056052--23056084
16
2.1
16
88
11
50
63
3
0
33
1.10
23056040--23056098
18
3.2
19
80
9
68
64
1
0
33
1.04
23056040--23056094
20
2.8
20
78
15
62
63
1
0
34
1.05
23056500--23056587
35
2.5
35
96
0
167
35
18
15
30
1.92
23058964--23059245
141
2.1
134
87
4
402
30
14
15
39
1.88
23067580--23067642
25
2.5
25
89
5
92
28
17
6
47
1.72
23068142--23068193
22
2.3
23
83
3
61
69
13
9
7
1.37
23072215--23072248
5
6.8
5
100
0
68
82
0
0
17
0.67
23073751--23073865
44
2.6
44
85
2
149
35
13
22
27
1.92
23073751--23073884
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
23079904--23080018
44
2.6
44
85
2
149
35
13
22
27
1.92
23079904--23080037
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
23083819--23083933
44
2.6
44
85
2
149
35
13
22
27
1.92
23083819--23083952
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
23088734--23088841
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23092476--23092583
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
23099836--23099939
44
2.3
44
86
3
136
30
20
14
34
1.92
23107361--23107428
35
1.9
35
85
5
93
27
13
1
57
1.45
23108172--23108332
3
55.0
3
70
15
70
27
4
4
63
1.34
23108291--23108329
20
2.0
20
89
0
60
30
5
2
61
1.31
23108295--23108332
17
2.2
17
86
9
51
31
2
0
65
1.06
23108392--23108437
21
2.1
23
84
8
60
34
2
2
60
1.21
23108407--23108462
25
2.2
26
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28
3
1
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1.19
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15
4.5
15
71
16
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59
1
3
36
1.22
23109113--23109142
15
2.0
15
93
0
51
73
0
23
3
0.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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