Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  287  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86584518--86584598
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24
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10
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22
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1.90
86584567--86584649
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3.2
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19
18
1.90
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4
54
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1
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61
1.23
86588619--86588713
25
3.6
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1
3
62
1.18
86588521--86588711
10
20.4
9
67
18
97
32
1
3
61
1.23
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2.5
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0
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0
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0
50
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23
1.97
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2.0
20
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0
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0
0
50
1.00
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2.0
114
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32
17
15
35
1.91
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3.4
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11
515
30
17
16
35
1.92
86624179--86624301
57
2.2
57
88
2
178
29
18
19
32
1.96
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110
2.4
110
84
6
339
31
15
19
34
1.92
86624351--86624618
111
2.4
110
84
7
350
31
15
19
34
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86624318--86624618
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16
19
32
1.94
86624549--86624673
56
2.2
56
80
4
137
33
18
16
32
1.93
86624424--86624726
166
1.8
166
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7
400
31
16
19
33
1.94
86626997--86627076
20
4.1
19
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4
79
35
12
11
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1.79
86627096--86627149
20
2.7
20
79
0
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44
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2.0
37
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2
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50
20
5
24
1.69
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40
3.4
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14
122
36
7
13
42
1.73
86627377--86627503
20
6.4
19
68
17
53
35
7
13
44
1.71
86627453--86627525
20
3.6
21
77
14
66
36
8
13
41
1.75
86627399--86627523
40
3.1
39
78
8
128
34
8
15
42
1.76
86627576--86627710
20
6.6
21
70
8
91
42
11
7
38
1.70
86627606--86627710
40
2.6
40
80
5
133
41
12
6
39
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2.1
16
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6
0
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0
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26
28
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1.91
86644094--86644172
28
2.8
28
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0
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29
26
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1.91
86646340--86646364
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1.9
13
100
0
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0
0.24
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0
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0
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29
2.5
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81
14
86
35
6
10
47
1.64
86648956--86649016
31
2.0
31
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0
86
42
14
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34
1.76
86649423--86649452
2
14.5
2
93
6
51
46
3
0
50
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86650223--86650275
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2.4
23
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9
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64
0
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32
1.12
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21
2.2
21
81
11
51
67
0
4
28
1.10
86650465--86650499
18
2.0
17
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5
0
20
1.02
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27
3.5
24
75
13
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31
20
32
16
1.95
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27
7.4
27
80
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234
28
25
30
14
1.95
86658375--86658592
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3.9
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1
316
29
24
30
15
1.95
86658386--86658592
84
2.5
81
80
8
236
28
25
30
14
1.95
86661583--86661615
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0
0
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0
0
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0
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25
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25
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1.95
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195
1.8
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597
22
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16
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1.93
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208
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21
20
23
1.97
86682978--86683135
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2.3
69
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2
183
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20
22
1.97
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2.4
16
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53
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2
30
1.21
86686379--86686408
15
2.0
15
100
0
60
40
6
20
33
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86694527--86694666
27
5.2
28
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5
184
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22
24
17
1.96
86696260--86696444
26
7.2
26
90
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270
35
23
6
34
1.81
86696260--86696444
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2.4
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91
2
295
35
23
6
34
1.81
86700398--86700537
27
5.2
28
89
5
175
35
22
23
17
1.95
86702152--86702339
26
7.2
26
93
3
308
35
23
6
34
1.81
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21
2.0
21
100
0
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19
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28
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0
62
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38
0
22
1.54
86711949--86711984
16
2.2
16
90
0
54
41
38
0
19
1.52
86712130--86712201
32
2.2
32
82
4
92
41
19
9
29
1.83
86714282--86714324
12
3.7
12
82
17
63
32
16
11
39
1.84
86714283--86714329
23
2.0
23
100
0
94
29
17
12
40
1.86
86715604--86715647
21
2.1
21
82
0
52
31
4
6
56
1.46
86716046--86716123
17
4.7
17
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22
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61
2
5
30
1.31
86716046--86716123
18
4.7
18
67
27
57
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2
5
30
1.31
86719775--86719815
21
2.0
21
90
0
64
24
17
29
29
1.97
86724457--86724570
9
12.3
9
78
15
85
57
0
3
37
1.22
86724447--86724570
30
4.4
29
77
12
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58
0
4
35
1.25
86724457--86724561
19
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0
2
37
1.19
86725171--86725405
121
1.9
121
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0
407
35
8
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42
1.75
86737165--86737299
42
3.2
42
96
0
252
19
34
26
20
1.96
86739141--86739167
12
2.2
12
100
0
54
7
14
29
48
1.71
86739191--86739438
41
6.1
41
85
5
265
32
18
22
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86739200--86739441
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2.0
120
84
2
313
30
19
23
26
1.98
86740165--86740208
16
2.6
17
82
7
54
52
2
2
43
1.26
86740177--86740226
26
1.9
26
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0
73
50
4
4
42
1.40
86746393--86746533
43
3.3
42
88
2
201
26
19
26
26
1.99
86748930--86749063
26
5.2
26
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0
250
35
25
7
32
1.84
86753762--86753790
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11
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0
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0
0
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22
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0
27
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1
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1.14
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2.3
22
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63
1
0
34
1.06
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2.0
17
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1.28
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100
0
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0
0
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2
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2
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0
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0
0
52
1.00
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4.9
18
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2
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31
1.93
86764815--86764908
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136
30
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1.94
86772142--86772373
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2.6
88
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13
276
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1.84
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1.9
18
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58
5
5
29
1.45
86776179--86776216
13
2.8
13
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15
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44
15
0
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21
16
1.91
86779368--86779477
26
4.2
26
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2
177
36
24
4
34
1.76
86784334--86784364
12
2.6
12
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0
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16
51
22
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1.73
86785822--86785909
27
3.3
26
85
7
113
38
22
22
15
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86787518--86787627
26
4.2
26
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2
177
36
24
4
34
1.76
86787987--86788038
10
5.4
10
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9
11
0
78
0.95
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96
1.9
98
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2
281
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27
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27
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5
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10
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79
0
2
18
0.85
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76
0
1
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0
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0
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58
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0
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36
1.92
86814417--86814546
44
2.9
44
77
1
116
30
23
18
28
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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